Руководитель: Алешин Владимир Вениаминович
Основные научные направления
Исследования по молекулярной филогенетике, эволюционной геномике и молекулярной биогеографии различных групп животных и растений. Реконструкции филогении цветковых и других сосудистых растений, мохообразных, рыб, гастротрих, иглокожих, мезозой, моллюсков и протистов. Мета-штрихкодирование эукариотического микробиома бореальных сфагновых болот и пикопланктона арктических морей.
Основные научные результаты
I. Определена полная последовательность пластидного генома Paeonia lactiflora (Paeoniaceae: Saxifragales). Длина пластома P. lactiflora составляет 152747 п.н., в нем выявлено 130 генов, из которых 85 являются белок-кодирующими, 37 кодируют тРНК и 8 – рРНК. Порядок генов в пластомах всех пионов и других Saxifragales одинаков, но у пионов псевдогенизирован ген рибосомного белка rps18, и утрачены гены rpl32 и infA. Последовательности пластомов пионов различаются между собой небольшим количеством замен и инделей как в кодирующих, так и в спейсерных областях, при этом отличительной чертой пластома P. lactiflora является инверсия шести п.н. в спейсере trnH-psbA, которой нет ни у P. obovata, ни у P. veitchii. Сопоставление скоростей накопления замен показало, что для пластомов семейства пионовых характерна более высокая скорость по сравнению с другими представителями порядка Saxifragales (Liquidambar formosana и Penthorum chinense), что согласуется с ранее полученными данными по отдельным хлоропластным генам. Для реконструкции родственных взаимоотношений использованы полные геномы без исключения спейсерных последовательностей. Филогенетический анализ показал, что P. lactiflora и P. veitchii более близкородственны, чем каждый из них к P. obovata, что хорошо согласуется с результатами, полученными другими исследователями на основе анализа вариабельных ядерных последовательностей. В топологии реконструированного филогенетического дерева пионов концевые ветви имеют незначительную длину, что свидетельствует об относительно недавней дивергенции по крайней мере этой тройки видов и сильно контрастирует с довольно долгим периодом эволюционирования семейства пионов, которое по разным оценкам составляет порядка 90-110 млн лет. Реконструированное филогенетическое дерево позволяет заключить, что общий предок пионов, по всей видимости, имел травянистую форму, а древесные формы развились позднее и произошли от травянистых пионов.
Определены полные последовательности пластидных геномов Prangos trifida и Seseli montanum (Apiaceae: Apioideae), Carmichaelia australis (Leguminosae: Papilionoideae), а также митохондриальных геномов мхов Brachythecium rivulare, Mielichhoferia elongate и Polytrichum commune. По последовательностям генов органелл и спейсеров ядерной рДНК осуществлена реконструкци филогении указанных групп покрытосеменных, мхов и юнгерманниевых печеночников.
II. Изучены закономерности коэволюции ядерного генома и генома пластид у цветковых растений при потере фотосинтетической активности. Проведено описание и анализ происходящих при этом изменений в структуре и экспрессии ядерного генома и генома пластид в различных линиях эволюции цветковых растений. Секвенированы, собраны и проаннотированы транскриптомы Hypopitys monotropa и нефотосинтезирующего растения из семейства Orchidaceae, Epipogium aphyllum. Показано, что несмотря на независимый переход к гетеротрофности в этих двух эволюционных линиях растений, они обладают сходными закономерностями потерь генов. Установлено, что повышенная скорость накопления нуклеотидных замен не является универсально свойственной гетеротрофным растениям, как это предполагали ранее.
Секвенирование, сборка и аннотация пластидных геномов однодольных нефотосинтезирующих растений (с фокусом на семейства Thismiaceae и Orchidaceae). Проведен анализ структурных особенностей пластома – набора генов, динамики инвертированных повторов, GC-состава, информационной емкости различных генов и некодирующих участков.
III. Изучение генетического и фенотипического разнообразия подсолнечника.
186 линий подсолнечника из коллекции Всероссийского научно-исследовательского института масличных культур имени В.С. Пустовойта (ВНИИМК) охарактеризованы на основе их генотипа и общих морфологических и фенологических экономически важных черт. Для 99 линий определено содержание жирных кислот в семенах. Последовательность RAD-библиотек (Restriction site associated DNA markers) и последующий анализ выявили 65553 варианта, включая SNP и индели. Анализ неравновесности сцепления генов (LD) выявил значительную изменчивость в геноме. Самые длинные блоки LD (> 5000 Kb) были найдены в группах сцепления 1,5 и 17. Анализ выявил значительное генетическое и фенотипическое разнообразие коллекции подсолнечника ВНИИМК. Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) выявил связь геномных вариантов и фенотипических признаков. Новые заметные ассоциации с содержанием линоленовой кислоты в семенах были найдены в группах сцепления LG 8, 9 и 17.
IV. Из проб пикопланктона Кандалакшского залива Белого моря выделена ДНК, проведена ее амплификация на праймерах, комплементарным участкам 18S рДНК, фланкирующим V4 вариабельную область и осуществлено масштабное секвенирование амплификатов на платформе «Illumina» (США). Проведен таксономический анализ полученных метагеномов. Определен состав эукариотических пиководорослей рода Micromonas и Mantoniella (класс Mamiellophyceae) во льду и подледном планктоне Выявлена новая клада Micromonas и 4 клады Mantoniella, правомерность их выделения подтверждена анализом вторичной структуры V4 области 18S рРНК, для всех трех филотипов Micromonas. Впервые отмечено присутствие филотипа С Micromonas и нескольких филотипов Mantoniella во льдах. Присутствие филотипа Е2 Micromonas и его доминирование во льду и подледной воде Белого моря, относящегося к субарктическим морям, свидетельствует о том, что ареал распространения этого филотипа шире, чем предполагалось ранее. В пикопланктоне Белого моря впервые обнаружен представитель Pedinophyceae. На основании филогенетических реконструкций по последовательностям ядерной и хлоропластной рДНК, а также анализа вторичных структур рРНК этот штамм, обозначенный как Pedinophyceae WS, при наличии морфологических данных следовало бы отнести к новому виду и роду Marsupiomonadales.
V. Изучена изменчивость гена Onne-DAB, кодирующего β-цепь главного комплекса гистосовместимости класса II (MHCII), по мононуклеотидным заменам One_MHC2_109, One_MHC2_190v2 и One_MHC2_251v2 в двух крупнейших популяциях нерки азиатского побережья Тихого океана, воспроизводящихся в бассейнах рек Озерная и Камчатка. В выборках из данных озерно-речных систем прослеживались различия в характере наследования и степени полиморфизма этих локусов. Выборкам, собранным на озерных и речных нерестилищах оз. Курильское, были свойственны высокие оценки внутрипопуляционного генетического разнообразия; при этом межвыборочных различий по частотам гаплотипов и фенотипов объединенного локуса MHC2 выявлено не было. Напротив, в выборках ранней (весенней) нерки из бассейна р. Камчатки отмечены низкие оценки генетического разнообразия и значимая гетерогенность гаплотипических и фенотипических частот по локусу MHC2. Высокое разнообразие гаплотипов нерки озера Курильское может быть интерпретировано как результат действия балансирующего отбора по последовательностям, кодирующим пептид-связывающий участок молекулы MHC класса II нерки данной популяции, и наоборот низкая гетерогенность весенних выборок из р. Камчатка может объясняться действием направленного патоген-индуцированного отбора по гену Onne-DAB в ряде локальностей данной озерно-речной системы.
Проведены филогенетические исследования европейского хариуса Thimallus thimallus и путей его расселения на основе генотипирования по двум митохондриальным маркерам (D-петля и АТФ6) и двум ядерным (α TNF – фактор некроза опухолей и FSH – фолликуло-стимулирующий гормон).Анализирован фрагмент митохондриальной ДНК хариуса, который включал полную последовательность D-петли. Выборка содержала 224 рыбы из 23 водных бассейнов, из которых 198 особей представляли Европейского хариуса и 26 – Арктического (T. arcticus). Генотипирование D-петли мтДНК хариуса позволило обнаружить 32 гаплотипа, из которых 29 описаны впервые.
VI. Проведен aнализ встречаемости интрона группы I в положении S943 в 18S рДНК эукариот и наличия гена эндонуклеазы хоминга в интроне. Обнаружен и описан интрон группы I с позицией вставки S943 у одного из видов хитридиевых грибов. Интрон несет ген эндонуклеазы хоминга, который локализуется на антисмысловой цепи области Р8. Предсказанный на основе трансляции in silico белок эндонуклеазы не имеет на С-конце второго цинк-связывающего мотива, которые характерен для белков семейства His-Cys. Однако консервативный мотив может быть обнаружен, если в нуклеотидную последовательность ввести множественные сдвиги рамки. Гены эндонуклеазы в 18S рДНК были обнаружены до сих пор в двух видах цитридиомицетов: Gonapodya sp. JEL612 (та же позиция вставки S943) и Phlyctochytrium planicorne (другое положение вставки интрона S508). Структура белок-кодирующих последовательностей в интроне группы I хитридиевого гриба свидетельствует, что эти последовательности представляют собой псевдоген хоминговой эндонуклеазы семейства His-Cys. Сходство хоминговых эндонуклеаз из интронов хитридиевого гриба и моноблефарового гриба Gonapodia sp. JEL612 свидетельствует, что эти низшие зооспоровые грибы получили гены эндонуклеазы из одного источника: от древнего общего предка или горизонтально от одного пока неизвестного источника. Показано мозаичное распределение интронов и гена эндонуклеазы на филогенетическом дереве.
VII. Установлено, что у Trichoplax adhaerens (примитивного животного, лишенного нервной системы) отсутствуют ортологи всех известных серотониновых рецепторов высших животных, несмотря на присутствие в геноме закодированных элементов нервной системы и способности высокого уровня серотонина стимулировать положительный фототаксис. Определен состав микробиома Trichoplax adhaerens и чувствительность его компонентов к антибиотикам ампициллину и доксициклину. При обработке ампициллином доминирующие таксоны бактерий сменяются с Rhodobacteriaceae и Nocardioidaceae на Actinomycetales, а доксициклином — на Rhizobiales. Гибридизация in situ показала, что между клетками пищеварительного эпителия Trichoplax дикого типа находятся бактерии, окрашиваемые антителами к серотонину. Обработка обоими антибиотиками устраняет их, но серотонин-зависимое поведение животных от этого значимо не меняется.
VIII. Проведен анализ расширенного набора объединенных последовательностей генов 18 и 28S рРНК основных групп многоклеточных животных с включением в него полученных нами новых ПС двух видов мезозой и использованием наиболее эффективных методов реконструкции филогенетических деревьев. Новый анализ подтверждает как монофилию мезозой, так и образование группы плоских животных Platyzoa (гастротрихи, мезозои синдерматы и плоские черви).
IX. Проведён анализ популяций морского ежа Echinocardium cordatum в водах Атлантики и Пацифики севернее и южнее тропического пояса. Сравнение последовательностей фрагментов митохондриального гена 1-ой субъединицы цитохром оксидазы (СOI) показывает высокую степень отличий тихоокеанских популяций от атлантических и средиземноморских, что позволяет выделение его в отдельный вид в составе рода Echinocardium. Осуществлена реконструкция филогении и путей расселения глубоководных морских ежей отряда Holasteroida при использовании сравнения последовательностей митохондриальных генов (COI, 16S и 12S рРНК), а также вариабельных участков 18S и 28S ядерных генов рРНК. Молекулярно-генетический анализ по последовательностям гена COI подтвердил отнесение всех экземпляров морских звезд проблемного рода Hymenaster (Pterasteridae) из географически удаленных районов (от Гренландии до Карского моря) к одному виду, Hymenaster pellicidus.
X. Получены геномные данные для ортонектид и дициемид - беспозвоночных, характеризующихся крайне сильным упрощением организации. Эти группы ранее рассматривались как представители типа Mesozoa, что подчеркивало промежуточный уровень их организации между одноклеточными простейшими и настоящими многоклеточными животными. При помощи геномных данных уточнено филогенетическое положение ортонектид и дициемид, показав их принадлежность к группе Spiralia (спирально-дробящихся билатерально симметричных животных). Филогеномный анализ опровергает близкое родство ортонектид и дициемид, указывая на независимое упрощение организации в этих линиях. Их геномы демонстрируют высокую степень редукции состава транскрипционных факторов и генов, связанных с нервно-мышечной системой.
XI. Проведено исследование геномных данных для микроспоридии группы Мечниковеллид. Эти организмы характеризуются отсутствием ряда ультраструктурных черт, присущих типичным представителям микроспоридий, но их положение среди микроспоридий ранее не исследовалось методами молекулярной филогенетики. При помощи метода геномной амплификации получены геномные данные для мечниковеллиды, подтверждающие их базальное положение в группе микроспоридий. Геномные данные указывают на наличие редуцированной митохондрии (митосомы) у мечниковеллид – характерной черты анаэробного метаболизма микроспоридий. В противовес более дивергентным микроспоридиям, мечниковеллиды сохраняют элементы клатринового везикулярного транспорта, являясь промежуточным звеном в формировании авезикулярного комплекса Гольджи микроспоридий.
XII. В составе международного коллектива была проведена работа по исследованию транскриптомов представителей группы Apicomplexa (Alveolata). Транскриптомные данные позволили заполнить бреши в молекулярных данных по биоразнообразию альвеолят, включая свободноживущих (хищных) кольподеллид и кольпонемид, привели к описанию двух новых типов одноклеточных. Филогеномный анализ с применением этих данных обосновывает независимый переход к паразитическому образу жизни в группах споровиков, кольподеллид и базальной линии Apicomplexa (группы Squirmidea). Выявлено широкое распространение редуцированных хлоропластов среди Apicomplexa и зависимость от пластидного метаболизма – наследие фотосинтетического предка группы.
Участие в совместных научно-исследовательских проектах
Совместные исследования проводятся с сотрудниками биологического факультета МГУ, биолого-почвенного факультета Санкт-Петербургского университета, Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, Института биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН, Зоологического института РАН, Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН, Лимнологического института РАН, Института океанологии им. П.П. Ширшова РАН, Сколковского института науки и технологий, Главного ботанического сада РАН, Ботанического сада-института ДВО РАН, Университетского колледжа (Лондон), Университета Британской Колумбии (Канада), Флоридского университета (США).
Грантовая поддержка
Исследовательская работа в настоящее время поддерживается грантами:
РНФ – «Морфологическая и геномная эволюция паразитических альвеолят», «Геномные факторы перехода к паразитизму в эволюции нематод»;
РФФИ – «Паразиты и одноклеточные поедатели одноклеточных водорослей», «Исследование эволюции инфекционного рака животных (Metazoa) с помощью генерации и анализа Больших геномных и постгеномных данных», «Эволюционная геномика и молекулярная филогенетика мхов и печеночников».
Преподавательская деятельность
Спецкурс «Молекулярная ботаника» на биологическом факультете МГУ.
Статьи
- Grigoryan Maxim Yu, Volkova Polina A., Ivanova Maria O., Mochalova Olga A., Logacheva Maria D., Neretina Tatyana V., Bobrov Alexander A.(2025) No endemic Isoëtes (Isoëtaceae) species in the North Asian Pacific evidenced by genetic and morphological analysis. Aquatic Botany, >>
- Kashko Nataliia D., Muravyov Georgii, Karavaeva Iuliia, Glagoleva Elena S., Logacheva Maria D., Garushyants Sofya K., Knorre Dmitry A.(2025) Inheritance bias of deletion-harbouring mtDNA in yeast: The role of copy number and intracellular selection. PLoS Genetics, >>
- Degtjareva Galina V., Samigullin Tahir H., Valiejo-Roman Carmen M., Chatelain Cyrille, Sokoloff Dmitry D., Kramina Tatiana E.(2025) Filling the Last Major Gap in the Phylogeny of Lotus (Leguminosae): The Nearly Extinct Lotus benoistii from Morocco, a Potentially Important Breeding Resource. Taxonomy, >>
- Доманов М.М., Демидов А.Б., Суханова И.Н., Т А.Белевич(2025) Влияние малых доз у-излучения на первичную продукцию и скорость роста клеток в популяции морского фитопланктона. Физиология растений, >>
- Остроумова Т.А., Дегтярева Г.В., Жуланова Н.И., Крюкова М.М.(2025) Молекулярная идентификация материала народных музыкальных инструментов – многоствольных травяных флейт. Бюл. Моск. о-ва испытателей природы. отд. биол. Бюллетень Московского общества испытателей природы. Отдел биологический, >>
- Miroliubova Tatiana S., Mikhailov Kirill V., Simdyanov Timur G., Aleoshin Vladimir V., Dũng Đinh Thế, Kudriavkina Aleksandra I.(2025) Parasites specific to centipedes form a new major lineage of terrestrial gregarines. Scientific reports, >>
- Nikolaeva Olga V., Mikhailov Kirill V., Muntyan Maria S., Zverkov Oleg A., Spirin Sergey A., Lyubetsky Vassily A., Slyusarev Georgy S., Vladimir V.Aleoshin(2025) Rare evolutionary events support the phylogenetic placement of Orthonectida within Annelida. International Journal of Molecular Sciences, >>
- Lyupina Yulia V., Adameyko Kim I., Zubarev Vasiliy M., Cherkasov Alexander V., Ryabova Alina V., Mikhailov Kirill V., Golyshev Sergey A., Burakov Anton V., Finoshin Alexander D., Erokhov Pavel A., Sabirov Marat S., Zhurakovskaya Anna I., Ziganshin Rustam (2025) The divergent intron-containing actin in sponge morphogenetic processes. NAR Genomics and Bioinformatics, >>
- Biserova N.M., Bannikova M.A., Nikolaeva O.V., Aleoshin V.V.(2025) Do eutardigrades have a copulatory organ? The case of Halobiotus crispae Kristensen. Зоология беспозвоночных, >>
- Khan Nazar, Lyskov Dmitry, Sultan Amir, Ukrainskaja Uliana, Samigullin Tahir, Khan Tahir, Ishaq Kamran, Khan Amjad(2025) Semenovia zhobica (Apiaceae), a new species from Northern Balochistan, Pakistan. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Panahi Mehrnoush, Samigullin Tahir(2025) Pimpinella insignis (Apiaceae) is a synonym of P. pastinacifolia. Phytotaxa, >>
- Samigullin Tahir H., Kopylov-Guskov Yury O., Nikitina Olga V., Krinitsina Anastasiya A., Polevova Svetlana V., Kramina Tatiana E.(2025) Sixteen New Complete Plastid Genomes in the Tribe Loteae (Leguminosae): Structure and Phylogenetic Analysis. Plants, >>
- Diep T.T.N, Doan H.T.T, Bui H.Q., Averyanov L.V., Lyskov D.F., Samigullin T.H., Sennikov A.N., Nuraliev M.S.(2025) An overview of the genus Osmanthus (Oleaceae) in Vietnam, with two new records and lectotypifications. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Akalın Emine, Bagheri Ali, Terentieva Elena, Tuncay Hüseyin Onur, Kroupsky Ivan, Samigullin Tahir(2025) Break it and better it: molecular and morphological data support the split of Ferulago (Apiaceae) into four genera. Botanical Journal of the Linnean Society, >>
- Duran Ahmet, Lyskov Dmitry, Samigullin Tahir, Dündar Ekrem(2025) Pimpinella husnucan-baseri (Apiaceae), a new species from South Anatolia, Turkey. Phytotaxa, >>
- Jadranin BZ, Ćosić MV, Božović DP, Vujičić MM, Ignatov MS, Troitsky AV, Sabovljević AD, Sabovljević MS(2025) Advances in conservation physiology and ex situ propagation strategies for the rare moss Podperaea krylovii (Amblystegiaceae, Bryophyta). Nature Conservation, >>
- Лобачева Г.В., Алшибая М.Д., Мамалыга М.Л., Максимова А.Г.(2024) Периоперационные факторы риска развития острого нарушения мозгового кровообращения у пациентов после геометрической реконструкции левого желудочка. Клиническая физиология кровообращения, >>
- Samigullin T.H., Logacheva M.D., Averyanov L.V., Zeng S.J., Fu L.F., Nuraliev M.S.(2024) Phylogenetic position and plastid genome structure of Vietorchis, a mycoheterotrophic genus of Orchidaceae (subtribe Orchidinae) endemic to Vietnam. Frontiers in plant science, >>
- Schelkunov Mikhail I., Shtratnikova Viktoria Yu, Klepikova Anna V., Makarenko Maksim S., Omelchenko Denis O., Novikova Lyudmila A., Obukhova Ekaterina N., Bogdanov Viktor P., Penin Aleksey A., Logacheva Maria D.(2024) The genome of the toxic invasive species Heracleum sosnowskyi carries an increased number of genes despite absence of recent whole‐genome duplications. Plant Journal, >>
- Sokoloff Dmitry D., Degtjareva Galina V., Valiejo-Roman Carmen M., Severova Elena E., Barinova Sophia, Chepinoga Victor V., Kuzmin Igor V., Sennikov Alexander N., Shmakov Alexander I., Skaptsov Mikhail V., Smirnov Sergey V., Remizowa Margarita V.(2024) Kazakhstan has an unexpected diversity of medicinal plants of the genus Acorus (Acoraceae) and could be a cradle of the triploid species A. calamus. Plants, >>
- Sokoloff Dmitry D., Degtjareva Galina V., Skaptsov Mikhail V., Vislobokov Nikolay A., Kirejtshuk Alexander G., Sennikov Alexander N., Severova Elena E., Chepinoga Victor V., Samigullin Tahir H., Valiejo‐Roman Carmen M., Smirnov Sergey V., Shmakov Alexande(2024) Diploids and tetraploids of Acorus (Acoraceae) in temperate Asia are pseudocryptic species with clear differences in micromorphology, DNA sequences and distribution patterns, but shared pollination biology. Taxon, >>
- Demidov A.B., Belevich T.A., Eremeeva E.V., Tiurina A.S., Vorobieva O.V., Artemiev V.A., Pronina J.O., Flint M.V.(2024) Estimation of the Contribution of Size-Fractionated Phytoplankton in the Kara Sea to Primary Production and Chlorophyll a during Different Seasons. Oceanology, >>
- Belevich T.A., Demidov A.B., Vorob'eva O.V., Polukhin A.A., Flint M.V.(2024) Picocyanobacteria in the Ob Estuary and Adjacent Kara Sea Shelf in Late Autumn: Composition, Distribution and Functional Role. Oceanology, >>
- Радченко И.Г., Белевич Т.А., Аксенова В.А., Иванова Д.А.(2024) Бесконечное разнообразие микроводорослей Белого моря. Природа, >>
- Belevich T.A., Milyutina I.A., Vorob’eva O.V., Troitsky A.V.(2024) The rDNA Diversity, Interseasonal Dynamic, and Functional Role of Cyanobacteria Synechococcus in the Sub-Arctic White Sea. Plants, >>
- Belevich Tatiana A., Demidov Andrey B., Vorob’eva Olga V., Polukhin Alexandr A., Shchuka Sergey A., Eremeeva Elena V., Flint Michail V.(2024) Photoautotrophic Picoplankton of the Kara Sea in the Middle of Summer: Effect of First-Year Ice Retreat on Carbon and Chlorophyll Biomass and Primary Production. Marine Environmental Research, >>
- Белевич Т.А., Демидов А.Б., Воробьева О.В., Полухин А.А., Флинт М.В.(2024) Пикоцианобактерии в эстуарной зоне реки Обь и прилегающем шельфе Карского моря в позднеосенний период: состав, распределение и функциональная роль. Океанология, >>
- Демидов А.Б., Белевич Т.А., ЕРЕМЕЕВА Е.В., ТЮРИНА А.С., ВОРОБЬЕВА О.В., АРТЕМЬЕВ В.А., ПРОНИНА Ю.О., ФЛИНТ М.В.(2024) Оценка вклада размерных групп фитопланктона Карского моря в величины первичной продукции и хлорофилла в разные сезоны. Океанология, >>
- Дегтярева Г.В., Ефимов С.В., Терентьева Е.И.(2024) Вклад Алтайского региона в генетическое разнообразие Paeonia anomala L. Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, >>
- Duran Ahmet, Kljuykov Eugene, Degtjareva Galina, Samigullin Tahir, Lyskov Dmitry(2024) Bunium serdengectii (Apiaceae), a new species from South Anatolia, Turkey. Phytotaxa, >>
- Wijayawardene Nalin N., Hyde Kevin D., Mikhailov Kirill V., Péter Gábor, Aptroot André, Pires-Zottarelli Carmen L.A., Goto Bruno T., Tokarev Yuri S., Haelewaters Danny, Karunarathna Samantha C., Kirk Paul M., de A Santiago André L.C.M, Saxena Ramesh K., S(2024) Classes and phyla of the kingdom Fungi. Fungal Diversity, >>
- Nikolaeva O.V., Rusin L.Y., Mikhailov K.V., Aleoshin V.V., De Ley P.(2024) Both strand gene coding in a plastome‐like mitogenome of an enoplid nematode. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, >>
- Golyshev Sergei A., Lyupina Yulia V., Kravchuk Oksana I., Mikhailov Kirill V., Gornostaev Nicolay G., Burakov Anton V.(2024) Transient Interphase Microtubules Appear in Differentiating Sponge Cells. Cells, >>
- Korzhavina O.A., Nikitin M.A., Hoeksema B.W., Armenteros M., Reimer J.D., Ivanenko V.N.(2024) Tracing Geographic and Molecular Footprints of Copepod Crustaceans Causing Multifocal Purple Spots Syndrome. Diversity, >>
- Khanaychenko Antonina N., Nikolaeva Olga V., Rylkova Olga A., Saburova Maria, Aleoshin Vladimir V.(2024) Genus Proteomonas is not monotypic: P. agilis sp. nov. (Cryptophyceae, Geminigeraceae) from the Black Sea and hidden diversity of Proteomonas species. Botanica Marina, >>
- Minin Kirill V., Mironov Alexandr N., Petrov Nikolay B., Vladychenskaya Irina P.(2024) Evolutionary and biogeographic patterns in the deep-sea echinoid families Pourtalesiidae Agassiz 1881 and Ceratophysidae fam. nov. (Echinoidea). Zoological Journal of the Linnean Society, >>
- Duran Ahmet, Lyskov Dmitry, Samigullin Tahir, Paksoy Mehmet Yavuz(2024) Heracleum munzurense (Apiaceae), a new species from East Anatolia, Turkey and taxonomic position of Tetrataenium lasiopetalum. Phytotaxa, >>
- Sultan Amir, Khan Nazar, Kljuykov Eugene, Khan Amjad, Samigullin Tahir, Lyskov Dmitry(2024) Review of the Komarovieae (Apiaceae) with inclusion of monotypic Afghan genus Mastigosciadium and description of a new genus from Northern Balochistan, Pakistan. Botanical Journal of the Linnean Society, >>
- Duran Ahmet, Samigullin Tahir, Lyskov Dmitry(2024) A new taxonomic treatment and comprehensive evaluation of the genus Aegokeras (Apiaceae) endemic to Turkey. Phytotaxa, >>
- Kramina Tatiana E., Hadziev Tamerlan R., Samigullin Tahir H.(2024) The Lotus angustissumus Group (Fabaceae): Can Phylogenetic Patterns Be Accommodated by a Taxonomic Concept?. Plants, >>
- Bakalin VA, YD Maltseva, KG Klimova, VS Nguyen, SS Choi, AV Troitsky(2024) New insight into the taxonomy ofCephaloziellaceae (Marchantiophyta): thefamily of the smallest higher plants on Earth. Frontiers in plant science, >>
- Bakalin Vadim A., Maltseva Yulia D., Troitsky Aleksey V.(2024) The Position of Lophozia dubia (Lophoziaceae, Marchantiophyta) in the Phylogenetic System of Lophozia and the Distribution of Lophozia in Southeast Eurasia, Extending to Indonesia. Plants, >>
- Kiriukhin B.A., Belevich T.A., Milyutina I.A., Logacheva M.D., Tikhonenkov D.V.(2023) Diversity of heterotrophic picoeukaryotes in the ice of the Kandalaksha Gulf (White Sea, Russia) based on rRNA gene high-throughput sequencing. Marine Biodiversity, >>
- Sokoloff Dmitry D., Malyshkina Raisa A., Remizowa Margarita V., Rudall Paula J., Fomichev Constantin I., Fesenko Aleksey N., Fesenko Ivan N., Logacheva Maria D.(2023) Reproductive development of common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench) and its wild relatives provides insights into their evolutionary biology. Frontiers in plant science, >>
- Belevich T.A., Milyutina I.A., Troitsky A.V.(2023) Picocyanobacteria in Estuaries of Three Siberian Rivers and Adjacent Shelves of Russian Arctic Seas: Genetic Diversity and Distribution. Diversity, >>
- Tolstikov A.V., Galakhina N.E., Belevich T.A., Usov N.V., Zdorovennov R.E.(2023) Results of Expeditionary Studies of the Onezhskiy Bay in the White Sea in September. Physical Oceanography, >>
- Толстиков А.В., Галахина Н.Е., Белевич Т.А., Усов Н.В., Здоровеннов Р.Э.(2023) Результаты экспедиционных исследований Онежского залива Белого моря в сентябре 2019 года. Морской гидрофизический журнал, >>
- Demidov A., Belevich T., Sheberstov S.(2023) Optimal assimilation number of phytoplankton in the Siberian seas: spatiotemporal variability, environmental control and estimation using a Region-Specific Model. Journal of Marine Science and Engineering, >>
- GORYUNOV DENIS, PIKUNOVA ANNA, KNYAZEV SERGEY, DOLZHIKOVA MARIA, PAVLENKO ANNA, GORYUNOVA SVETLANA(2023) The chloroplast genome of black currant (DNA.) cultivar 'Kipiana': genome structure and chloroplast Simple Sequence Repeats. Research on Crops, >>
- Goryunova Svetlana, Sivolapova Anastasia, Polivanova Oksana, Sotnikova Evgeniia, Meleshin Alexey, Gaitova Natalia, Egorova Anna, Semenov Anatoly, Gins Ekaterina, Koroleva Alina, Moskalev Evgeny, Oves Elena, Kazakov Oleg, Troitsky Aleksey, Goryunov Denis(2023) Comparative Study of Plastomes of Solanum tuberosum with Different Cytoplasm Types. Plants, >>
- Gubaev Rim, Boldyrev Stepan, Martynova Elena, Chernova Alina, Kovalenko Tatyana, Chebanova Yuliya, Peretyagina Tatyana, Goryunova Svetlana, Goryunov Denis, Mukhina Zhanna, Ben Cecile, Gentzbittel Laurent, Khaitovich Philipp, Demurin Yakov(2023) QTL mapping of oleic acid content in modern VNIIMK sunflower (Helianthus annuus L.) lines by using GBS-based SNP map. PLoS ONE, >>
- Pikunova Anna, Goryunova Svetlana, Golyaeva Olga, Dolzhikova Maria, Pavlenko Anna, Kurashev Oleg, Sotnikova Evgeniia, Polivanova Oksana, Sivolapova Anastasia, Kazakov Oleg, Goryunov Denis(2023) Plastome Data of Red Currant and Gooseberry Reveal Potential Taxonomical Issues within the Ribes Genus (Grossulariaceae). Horticulturae, >>
- Sivolapova Anastasia B., Polivanova Oksana B., Goryunov Denis V., Chebanova Yulia V., Fedorova Alina V., Sotnikova Evgeniia A., Karabitsina Yulia I., Benko Nikolai I., Mukhina Zhanna M., Anisimova Irina N., Demurin Yakov N., Goryunova Svetlana V.(2023) Refinement of Rf1-gene localization and development of the new molecular markers for fertility restoration in sunflower. Molecular Biology Reports, >>
- Клюйков Е.В., Дегтярева Г.В., Лысков Д.Ф.(2023) Таксономия и филогения некоторых клубневых зонтичных на основе анатомо-морфологических и молекулярных данных. Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, >>
- Kljuykov E.V., Zakharova E.A., Degtjareva G.V., Samigullin T.H.(2023) Infrageneric classification of Elwendia (Apiaceae) with a restored species. Phytotaxa, >>
- Pimenov M.G., Tojibaev K.SH, Degtjareva G.V., Ostroumova T.A., Zakharova E.A., Karimov F.I., Samigullin T.H.(2023) A new species of Aulacospermum (Umbelliferae) from Uzbekistan. Phytotaxa, >>
- Hyde K.D., Abdel-Wahab M.A., Abdollahzadeh J., Abeywickrama P.D., Absalan S., Afshari N., Ainsworth A.M., Akulov O.Y., Aleoshin V.V., Al-Sadi A.M., Alvarado P., Alves A., Alves-Silva G., Amalfi M., Amira Y., Amuhenage T.B., Anderson J.L., Antonín V., Aoua(2023) Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa. Mycosphere, >>
- Miroliubova T.S., Mikhailov K.V., Kudriavkina A.I., Frolova E.V., Ivanova E.V., Shmatko V.Yu, Efeykin B.D., V V.Aleoshin(2023) Phylogeny of stenophorid gregarines from millipedes (Diplopoda). Зоология беспозвоночных, >>
- Nikolaeva O.V., Beregova A.M., Efeykin B.D., Miroliubova T.S., Zhuravlev A.Yu, Ivantsov A.Yu, Mikhailov K.V., Spiridonov S.E., Aleoshin V.V.(2023) Expression of hairpin-enriched mitochondrial DNA in two hairworm species (Nematomorpha). International Journal of Molecular Sciences, >>
- Neverov A.M., Panchin A.Y., Mikhailov K.V., Batueva M.D., Aleoshin V.V., Panchin Yu V.(2023) Apoptotic gene loss in Cnidaria is associated with transition to parasitism. Scientific reports, >>
- Tchesunov A.V., Nikolaeva O.V., Rusin L.Yu, Sanamyan N.P., Panina E.G., Miljutin D.M., Gorelysheva D.I., Pegova A.N., Khromova M.R., Mardashova M.V., Mikhailov K.V., Yushin V.V., Petrov N.B., Lyubetsky V.A., Nikitin M.A., Aleoshin V.V.(2023) Paraphyly of Marimermithida refines primary routes of transition to parasitism in roundworms. Zoological Journal of the Linnean Society, >>
- Берегова А.М., Никитин М.А., Михайлов К.В., Ефейкин Б.Д.(2023) Безногие и безглазые животные. Палеонтологический журнал, >>
- Beregova A.M., Nikitin M.A., Mikhailov K.V., Efeykin B.D.(2023) Legless and Eyeless Animals. Paleontological Journal, >>
- Кравчук О.И., Финошин А.Д., Михайлов К.В., Зиганшин Р.Х., Адамейко К.И., Горностаев Н.Г., Жураковская А.И., Михайлов В.С., Шагимарданова Е.И., Люпина Ю.В.(2023) Характеристика дегидратазы δ-аминолевуленовой кислоты холодноводной губки Halisarca dujardinii. Молекулярная биология, >>
- Tikhonenkov Denis V., Mikhailov Kirill V., Gawryluk Ryan M.R., Keeling Patrick J.(2023) Provora. Current Biology, >>
- Gerasimova Elena A., Mindolina Yulia V., Tikhonenkov Denis V., Kataev Vladimir Y., Balkin Alexander S., Mikhailov Kirill V., Zagumyonnyi Dmitry G., Plotnikov Andrey O., Zlatogursky Vasily V.(2023) Unexpected ubiquity of heart‐shaped scale morphotype in Centroplasthelida (Haptista): Ancestral trait or multiple acquisitions?. Journal of Eukaryotic Microbiology, >>
- Никитин М.А., Алешин В.В.(2023) Больной вопрос о кодировании плана строения геномом. Палеонтологический журнал, >>
- Nikitin M.A., Aleshin V.V.(2023) A painful question about genomic coding of the body plan. Paleontological Journal, >>
- Никитин М.А., Борман С.И.(2023) Глутаматные и ГАМК-рецепторы безнервных животных (Placozoa): преадаптация к нейротрансмиссии. ЖУРНАЛ ОБЩЕЙ БИОЛОГИИ, >>
- Nikitin Mikhail A., Romanova Daria Y., Borman Simkha I., Moroz Leonid L.(2023) Amino acids integrate behaviors in nerveless placozoans. Frontiers in neuroscience, >>
- Mironov Alexandr N., Dilman Anna B., Petrov Nikolay B., Vladychenskaya Irina P.(2023) Taxonomic Status and Composition of the Genera Caulaster, Porcellanaster and Eremicaster (Asteroidea) Based on Juvenile Morphology and Molecular Phylogenetic Data. Diversity, >>
- Duran Ahmet, Samigullin Tahir, Lyskov Dmitry(2023) Aegokeras gazipashensis (Apiaceae), a new species from South Anatolia, Turkey. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Kroupsky Ivan, Samigullin Tahir, Fırat Mehmet(2023) Seseli kurdistanicum (Apiaceae), a new species from Van Province, eastern Turkey. Nordic Journal of Botany, >>
- Stroganov A.N., Ponomareva E.V., Ponomareva M.V., Shubina E.A., Zhukova K.A., Smirnov A.A., Rakitskaya T.A., Rakitina M.V.(2023) Phylogeny of the Genus Eleginus (Gadidae) According to the Analysis of the Variability of Microsatellite Locus and mtDNA COI Fragment. Russian Journal of Genetics, >>
- Строганов А.Н., Пономарева Е.В., Пономарева М.В., Шубина Е.А., Жукова К.А., Смирнов А.А., Ракицкая Т.А., Ракитина М.В.(2023) Филогения рода Eleginus (Gadidae) по данным анализа изменчивости микросателлитных локусов и фрагмента CO1 мтДНК. Генетика, >>
- Oleinik Alla G., Kukhlevsky Andrey D., Skurikhina Lubov A., Shubina Elena A.(2023) Complete mitochondrial genomes of Gritzenko’s charr Salvelinus gritzenkoi and Miyabe charr Salvelinus malma miyabei and their interpretation regarding intraspecific taxonomy. Molecular Biology Reports, >>
- Mikhailov Kirill V., Karpov Sergey A., Letcher Peter M., Lee Philip A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Nesterenko Maksim A., Pozdnyakov Igor R., Potapenko Evgenii V., Sherbakov Dmitry Y., Panchin Yuri V., Aleoshin Vladimir V.(2022) Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi. Current Biology, >>
- Valyaeva A.A., Tikhomirova M.A., Potashnikova D.M., Bogomazova A.N., Snigiryova G.P., Penin A.A., Logacheva M.D., Arifulin E.A., Shmakova A., Germini D., Kachalova A.I., Saidova A.A., Zharikova A.A., Musinova Y.R., Mironov A.A., Vassetzky Y.S., Sheval E.V(2022) Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients. PeerJ, >>
- Samigullin Tahir, Logacheva Maria, Terentieva Elena, Degtjareva Galina, Pimenov Michael, Valiejo-Roman Carmen(2022) Plastid Phylogenomic Analysis of Tordylieae Tribe (Apiaceae, Apioideae). Plants, >>
- Shcherbinina Evgeniya, Abakumova Tatiana, Bobrovskiy Daniil, Kurochkin Ilia, Deinichenko Ksenia, Stekolshchikova Elena, Anikanov Nickolay, Ziganshin Rustam, Melnikov Pavel, Khrameeva Ekaterina, Logacheva Maria, Zatsepin Timofei, Sergeeva Olga(2022) Murine Falcor/LL35 lncRNA Contributes to Glucose and Lipid Metabolism In Vitro and In Vivo. BIOMEDICINES, >>
- Shcherbinina Evgeniya, Abakumova Tatiana, Bobrovskiy Daniil, Kurochkin Ilia, Deinichenko Ksenia, Stekolshchikova Elena, Anikanov Nickolay, Ziganshin Rustam, Melnikov Pavel, Khrameeva Ekaterina, Logacheva Maria, Zatsepin Timofei, Sergeeva Olga(2022) Murine Falcor/LL35 lncRNA Contributes to Glucose and Lipid Metabolism In Vitro and In Vivo. BIOMEDICINES, >>
- Belevicha T.A., Milyutina I.A., Demidov A.B., Flint M.V.(2022) Spring Picophytoplankton of the Kara Sea. Oceanology, >>
- Белевич Т.А., Милютина И.А., Демидов А.Б., Флинт М.В.(2022) Весенний пикофитопланктон Карского моря. Океанология, >>
- Demidov A.B., Sergeeva V.M., Gagarin V.I., Eremeeva E.V., Vorobieva O.V., Belevich T.A., Artemiev V.A., Polukhin A.A., Grigoriev A.V., Khrapko A.N., Shchuka S.A., Flint M.V.(2022) Size-Fractionated Primary Production and Chlorophyll in the Kara Sea during the First-Year Ice Retreat. Oceanology, >>
- Демидов А.Б., Сергеева В.М., Гагарин В.И., Еремеева Е.В., Воробьева О.В., Белевич Т.А., Артемьев В.А., Полухин А.А., Григорьев А.В., Храпко А.Н., Щука С.А., Флинт М.В.(2022) Первичная продукция и хлорофилл размерных групп фитопланктона Карского моря в период схода сезонного льда. Океанология, >>
- Belevich T.A., Milyutina I.A.(2022) Species Diversity of Phototrophic Picoplankton in the Kara and Laptev Seas. Microbiology, >>
- Белевич Т.А., Милютина И.А.(2022) Видовое разнообразие фототрофного пикопланктона морей Карского и Лаптевых. Микробиология, >>
- Gubaev Rim, Boldyrev Stepan, Martynova Elena, Chernova Alina, Kovalenko Tatyana, Peretyagina Tatyana, Goryunova Svetlana, Goryunov Denis, Mukhina Zhanna, Ben Cecile, Gentzbittel Laurent, Khaitovich Philipp, Demurin Yakov(2022) Genetic mapping of loci involved in oil tocopherol composition control in Russian sunflower (Helianthus annuus L.) lines. G3 (Bethesda, Md.), >>
- Pikunova Anna, Goryunova Svetlana, Goryunov Denis, Golyaeva Olga, Dolzhikova Maria, Pavlenko Anna(2022) Genetic Diversity and Pedigree Analysis of Red Currant Germplasm. Plants, >>
- Pimenov Michael, Degtjareva Galina, Ostroumova Tatiana, Samigullin Tahir, Zakharova Ekaterina(2022) Polyphyletic Trachyspermum (Umbelliferae) revisited: a contribution of molecular and carpological data. Plant Biosystems, >>
- Lyskov Dmitry, Degtjareva Galina, Zarre Shahin, Terentieva Elena, Samigullin Tahir(2022) Neither Seseli nor Eriocycla: a new Iranian relict genus Shomalia (Apiaceae), related to Azilia. Plant Systematics and Evolution, >>
- Kljuykov E.V., Lazkov G.A., Degtjareva G.V., Zakharova E.A., Ukrainskaja U.A., Lyskov D.F., Samigullin T.H.(2022) Taxonomic revision of critical taxa of Elwendia (Umbelliferae-Apioideae) from Tajikistan and neighbouring countries, with descriptions of three new species from the Pamir-Alay and distributional novelties. Phytotaxa, >>
- Tikhonenkov Denis V., Mikhailov Kirill V., Gawryluk Ryan M.R., Belyaev Artem O., Mathur Varsha, Karpov Sergey A., Zagumyonnyi Dmitry G., Borodina Anastasia S., Prokina Kristina I., Mylnikov Alexander P., Aleoshin Vladimir V., Keeling Patrick J.(2022) Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes. Nature, >>
- Mikhailov K.V., Nassonova E.S., Shishkin Y.A., Paskerova G.G., Simdyanov T.G., Yudina V.A., Smirnov A.V., Janouškovec J., Aleoshin V.V.(2022) Ribosomal RNA of the metchnikovellids in gregarine transcriptomes and rDNA of the microsporidia sensu lato in environmental metagenomes. Biology Bulletin Reviews, >>
- Romanova Daria Y., Nikitin Mikhail A., Shchenkov Sergey V., Moroz Leonid L.(2022) Expanding of Life Strategies in Placozoa: Insights From Long-Term Culturing of Trichoplax and Hoilungia. Frontiers in Cell and Developmental Biology, >>
- Khanaychenko A.N., Popova O.V., Rylkova O.A., Aleoshin V.V., Aganesova L.O., Saburova M.(2022) Rhodomonas storeatuloformis sp. nov. (Cryptophyceae, Pyrenomonadaceae), a new cryptomonad from the Black Sea: morphology versus molecular phylogeny. Fottea, >>
- Yurtseva O.V., Vasilieva N.V., Kostikova V.A., Samigullin T.H.(2022) A broadly sampled 3-loci plastid phylogeny of Atraphaxis (Polygoneae,Polygonoideae, Polygonaceae) reveals new taxa: III. A. kuvaevii and сryptic speciesin A. pungens from Southern Siberia and Northern Mongolia. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Duran Ahmet, Paksoy Mehmet Yavuz, Samigullin Tahir(2022) Prangos munzurensis (Apiaceae), a new species from East Anatolia, Turkey. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Zarre Shahin, Terentieva Elena, Samigullin Tahir, Kljuykov Eugene(2022) Zeravschania sola (Apiaceae), a new species from Mazandaran Province, Northern Iran. Phytotaxa, >>
- Kramina Tatiana E., Lysova Maya V., Samigullin Tahir H., Özbek Mehmet U., Sokoloff Dmitry D.(2022) When Morphology and Biogeography Approximate Nuclear ITS but Conflict with Plastid Phylogeny: Phylogeography of the Lotus dorycnium Species Complex (Leguminosae). Plants, >>
- Bakalin Vadim A., Maltseva Yulia D., Klimova Ksenia G., Nguyen Van Sinh, Choi Seung Se, Troitsky Aleksey V.(2022) The systematic position of puzzling Sino-Himalayan Lophocolea sikkimensis (Lophocoleaceae, Marchantiophyta) is identified. PhytoKeys, >>
- Bakalin V.A., Maltseva Y.D., Müller F., Klimova K.G., Nguyen V.S., Choi S.S., Troitsky A.V.(2022) Calypogeia (Calypogeiaceae,Marchantiophyta) in Pacific Asia:Updates from Molecular Revisionwith Particular Attention to the Genus in North Indochina. Plants2022, 11, 983. https://doi.org/10.3390/plants11070983. Plants, >>
- Ponomareva Ekaterina V., Volkov Aleksandr A., Ponomareva Maria V., Makeenko Galina A., Shubina Elena A.(2022) European grayling phylogeographic lineages of Russian European North from barcoding DNA fragment. Bulgarian Journal of Agricultural Science, >>
- Ponomareva E.V., Volkov A.A., Ponomareva M.V., Shubina E.A.(2022) MtDNA Analysis of the Upper Yenisei Grayling (Thymallus svetovidovi) and the Mongolian Grayling (Thymallus brevirostris) and Clarification of Their Ranges. Biology Bulletin, >>
- Пономарева Е.В., Волков А.А., Пономарева М.В., Шубина Е.А.(2022) АНАЛИЗ мтДНК ВЕРХНЕЕНИСЕЙСКОГО (Thymallus svetovidovi) И МОНГОЛЬСКОГО (Thymallus brevirostris) ХАРИУСОВ, УТОЧНЕНИЕ ИХ АРЕАЛОВ. Известия Российской академии наук. Серия биологическая, >>
- Romanova E.V., Bukin Yu S., Mikhailov K.V., Logacheva M.D., Aleoshin V.V., Sherbakov D.Y.(2021) The mitochondrial genome of a freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii Is among the longest in Metazoa. Genes, >>
- Goryunov Denis V., Sotnikova Evgeniia A., Goryunova Svetlana V., Kuznetsova Oxana I., Logacheva Maria D., Milyutina Irina A., Fedorova Alina V., Fedosov Vladimir E., Troitsky Aleksey V.(2021) The Mitochondrial Genome of Nematodontous Moss Polytrichum commune and Analysis of Intergenic Repeats Distribution Among Bryophyta. Diversity, >>
- Schelkunov M.I., Nuraliev M.S., Logacheva M.D.(2021) Genomic comparison of non-photosynthetic plants from the family Balanophoraceae with their photosynthetic relatives. PeerJ, >>
- Scobeyeva Victoria A., Artyushin Ilya V., Krinitsina Anastasiya A., Nikitin Pavel A., Antipin Maxim I., Kuptsov Sergei V., Belenikin Maxim S., Omelchenko Denis O., Logacheva Maria D., Konorov Evgenii A., Samoilov Andrey E., Speranskaya Anna S.(2021) Gene Loss, Pseudogenization in Plastomes of Genus Allium (Amaryllidaceae), and Putative Selection for Adaptation to Environmental Conditions. Frontiers in genetics, >>
- Penin Aleksey A., Kasianov Artem S., Klepikova Anna V., Kirov Ilya V., Gerasimov Evgeny S., Fesenko Aleksey N., Logacheva Maria D.(2021) High-Resolution Transcriptome Atlas and Improved Genome Assembly of Common Buckwheat, Fagopyrum esculentum. Frontiers in plant science, >>
- Yudina S.V., Schelkunov M.I., Nauheimer L., Crayn D., Chantanaorrapint S., Hroneš M., Sochor M., Dančák M., Mar S-S, Luu H.T., Nuraliev M.S., Logacheva M.D.(2021) Comparative analysis of plastid genomes in the non-photosynthetic genus Thismia reveals ongoing gene set reduction. Frontiers in plant science, >>
- Ulianov Sergey V., Zakharova Vlada V., Galitsyna Aleksandra A., Kos Pavel I., Polovnikov Kirill E., Flyamer Ilya M., Mikhaleva Elena A., Khrameeva Ekaterina E., Germini Diego, Logacheva Mariya D., Gavrilov Alexey A., Gorsky Alexander S., Nechaev Sergey K.(2021) Order and stochasticity in the folding of individual Drosophila genomes. Nature communications, >>
- Samigullin Tahir, Vallejo-Roman Carmen, Degtjareva Galina, Terentieva Elena I.(2021) Structural rearrangements in plastid genomes of Apiaceae as phylogenetic markers. BIO Web of Conferences, >>
- Fomichev Constantin I., Macfarlane Terry D., Valiejo-Roman Carmen M., Samigullin Tahir H., Degtjareva Galina V., Briggs Barbara G., Sokoloff Dmitry D.(2021) Two centuries from species discovery to diagnostic characters: molecular and morphological evidence for narrower species limits in the widespread SW Australian Anarthria gracilis complex (Restionaceae s.l./Anarthriaceae, Poales). PeerJ, >>
- Belevich T.A., Nikishova E.R., Tolstikov A.V., Galakhina N.E.(2021) On the Role of Small Photosynthetic Flagellatesin the Fall Phytoplankton Community of Onega Bay, White Sea. Oceanology, >>
- Belevich T.A., Milyutina I.A., Troitsky A.V.(2021) Seasonal Variability of Photosynthetic Microbial Eukaryotes (<3 µm) in the Kara Sea Revealed by 18S rDNA Metabarcoding of Sediment Trap Fluxes. Plants, >>
- Konyukhov I.V., Kotikova A.F., Belevich T.A., Ilyash L.V., Kravchishina M.D., Pogosyan S.I.(2021) Functional Activity of Phytoplankton and Optical Properties of Suspended Particulate Matter in Onega Bay of the White Sea. Oceanology, >>
- Конюхов И.В., Котикова А.Ф., Белевич Т.А., Кравчишина М.Д., Погосян С.И.(2021) Функциональное состояние фитопланктона и оптические характеристики взвеси Онежского залива Белого моря. Океанология, >>
- Belevich Tatiana A., Demidov Аndrey B., Makkaveev Peter N., Shchuka Sergei A., Flint Mikhail V.(2021) Picophytoplankton distribution along Khatanga Bay-shelf-continental slope environment gradients in the western Laptev Sea. Heliyon, >>
- Demidov A.B., Sukhanova I.N., Belevich T.A., Flint M.V., Gagarin V.I., Sergeeva V.M., Eremeeva E.V., Fedorov A.V.(2021) Size-fractionated surface phytoplankton in the Kara and Laptev seas: environmental control and spatial variability. Marine Ecology - Progress Series, >>
- Belevich Tatiana, Milyutina Irina, Abyzova Galina, Troitsky Aleksey(2021) The pico-sized Mamiellophyceae and a novel Bathycoccus clade from the summer plankton of Russian Arctic Seas and adjacent waters. FEMS Micriobiology Ecology, >>
- POLIVANOVA O.B., SIVOLAPOVA A.B., GORYUNOV D.V., FEDOROVA A.V., SOTNIKOVA E.A., CHEBANOVA Y.V., KARABITSINA Y.U.I, BENKO N.I., DEMURIN Y.N., GORYUNOVA S.V.(2021) Structural diversity of sunflower (Helianthus annuus L.) candidate Rf1 loci based on gene-specific PCR. Research on Crops, >>
- Chernova Alina I., Gubaev Rim F., Singh Anupam, Sherbina Katrina, Goryunova Svetlana V., Martynova Elena U., Goryunov Denis V., Boldyrev Stepan V., Vanyushkina Anna A., Anikanov Nikolay A., Stekolshchikova Elena A., Yushina Ekaterina A., Demurin Yakov N.,(2021) Genotyping and lipid profiling of 601 cultivated sunflower lines reveals novel genetic determinants of oil fatty acid content. BMC Genomics, >>
- Terentieva E.I., Degtjareva G.V., Efimov S.V., Varlygina T.I.(2021) Preliminary results of studying the genetic diversity of Malaxis monophyllos (Orchidaceae) in the Amur region. Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, >>
- Degtjareva Galina, Efimov Sergey(2021) The genetic diversity of Paeonia anomala (Paeoniaceae), as indicated by nuclear ITS and plastid ycf1 molecular markers. BIO Web of Conferences, >>
- Zakharova Ekaterina A., Pimenov Michael G., Degtjareva Galina V., Samigullin Tahir H.(2021) Berberocarum (Apiaceae), a new genus from the High Atlas Mountains (Morocco), with notes on some other NW African Umbelliferae–Apioideae. Nordic Journal of Botany, >>
- Дегтярева Г.В., Остроумова Т.А., Самигуллин Т.Х., Пименов М.Г.(2021) Положение рода Palimbia в системе семейства Umbelliferae. Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, >>
- Paskerova G.G., Miroliubova T.S., Valigurová A., Janouskovec J., Kováciková M., Diakin A., Sokolova Y.Y., Mikhailov K.V., Aleoshin V.V., Simdyanov T.G.(2021) Evidence from the resurrected family Polyrhabdinidae Kamm, 1922 (Apicomplexa: Gregarinomorpha) supports the epimerite, an attachment organelle, as a major eugregarine innovation. PeerJ, >>
- Михайлов К.В., Насонова Е.С., Шишкин Е.А., Паскерова Г.Г., Симдянов Т.Г., Юдина В.А., Смирнов А.В., Янушковец Я., Алешин В.В.(2021) Рибосомная РНК мечниковеллид в транскриптомах грегарин и рДНК микроспоридий sensu lato в метагеномах. ЖУРНАЛ ОБЩЕЙ БИОЛОГИИ, >>
- Kravchuk O.I., Burakov A.V., Gornostaev N.G., Mikhailov K.V., Adameyko K.I., Finoshin A.D., Georgiev A.A., Mikhailov V.S., Yeryukova Y.E., Rubinovsky G.A., Zayts D.V., Gazizova G.R., Gusev O.A., Shagimardanova E.I., Lyupina Y.V.(2021) Histone Deacetylases in the Process of Halisarca dujardini Cell Reaggregation. Russian Journal of Developmental Biology, >>
- Adameyko Kim I., Burakov Anton V., Finoshin Alexander D., Mikhailov Kirill V., Kravchuk Oksana I., Kozlova Olga S., Gornostaev Nicolay G., Cherkasov Alexander V., Erokhov Pavel A., Indeykina Maria I., Bugrova Anna E., Kononikhin Alexey S., Moiseenko Andre(2021) Conservative and Atypical Ferritins of Sponges. International Journal of Molecular Sciences, >>
- Mikhailov K.V., Ivanenko V.N.(2021) Low support values and lack of reproducibility of molecular phylogenetic analysis of Copepoda orders. Arthropoda Selecta, >>
- Moroz Leonid L., Nikitin Mikhail A., Poličar Pavlin G., Kohn Andrea B., Romanova Daria Y.(2021) Evolution of glutamatergic signaling and synapses. Neuropharmacology, >>
- Romanova Daria Y., Varoqueaux Frédérique, Daraspe Jean, Nikitin Mikhail A., Eitel Michael, Fasshauer Dirk, Moroz Leonid L.(2021) Hidden cell diversity in Placozoa: ultrastructural insights from Hoilungia hongkongensis. Cell and Tissue Research, >>
- Naimark Elena, Kirpotin Dmitry, Boeva Natalia, Gmoshinskiy Vladimir, Kalinina Maria, Lyupina Yulia, Markov Alexander, Nikitin Michail, Shokurov Alexander, Volkov Dmitry(2021) Taphonomic experiments imply a possible link between the evolution of multicellularity and the fossilization potential of soft‐bodied organisms. Ecology and evolution, >>
- Dilman Anna B., Minin Kirill V., Petrov Nikolay B.(2021) New record of the wood-associated sea star Caymanostella, with notes on the phylogenetic position of the family Caymanostellidae (Asteroidea). Zoological Journal of the Linnean Society, >>
- Duran Ahmet, Samigullin Tahir, Lyskov Dmitry(2021) Seseli salsugineum (Apiaceae), a new species from Central Anatolia, Turkey. Phytotaxa, >>
- Lyskov Dmitry, Zarre Shahin, Samigullin Tahir, Kljuykov Eugene(2021) Dichoropetalum viarium (Apiaceae), a new species from Lorestan Province, Western Iran. Phytotaxa, >>
- Terentieva Elena, Ukrainskaja Uliana, Lyskov Dmitry, Samigullin Tahir, Kljuykov Eugene(2021) New data for systematics of the genus Zeravschania (Apiaceae) and related taxa based on the nrDNA (ITS) sequences. BIO Web of Conferences, >>
- Turova Polina, Styles Iain, Timashev Vladimir, Kravets Konstantin, Grechnikov Alexander, Lyskov Dmitry, Samigullin Tahir, Podolskiy Ilya, Shpigun Oleg, Stavrianidi Andrey(2021) Unsupervised methods in LC-MS data treatment: application for potential chemotaxonomic markers search. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, >>
- Kramina Tatiana E., Yakovenko Elizaveta P., Koppel Larissa A., Samigullin Tahir H., Karpova Yulia A., Gakhova Edith N., Fesenko Eugeny E.(2021) Molecular taxonomic identification of a Silene plant regenerated from Late Pleistocene fruit material. Wulfenia, >>
- Kljuykov Eugene, Lyskov Dmitry, Ukrainskaja Uliana, Samigullin Tahir, Terentieva Elena(2021) Heracleum piliferum (Apiaceae), a new species from central Nepal. Phytotaxa, >>
- YURTSEVA OLGA V., Severova Elena E., DEVIATOV ANDREY G., OLONOVA MARINA V., SAMIGULLIN TAHIR H.(2021) Polygonum schischkinii is a member of Atraphaxis (Polygonaceae, Polygoneae): evidences from morphological and molecular analyses. Phytotaxa, >>
- Kramina Tatiana E., Lysova Maya V., Samigullin Tahir H., Schanzer Ivan A., Özbek Mehmet U., Sokoloff Dmitry D.(2021) Phylogenetic Placement and Phylogeography of Large-Flowered Lotus Species (Leguminosae) Formerly Classified in Dorycnium: Evidence of Pre-Pleistocene Differentiation of Western and Eastern Intraspecific Groups. Plants, >>