Подразделения Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов

Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов

Руководитель: Богачев Александр Валерьевич


Отдел организован в 2002 г.; с момента организации отдела и до настоящего времени им руководит д.б.н. А.В. Богачев.

Основные направления исследований

Исследование способов и эффектов мягкого разобщения, а также механизмов работы и регуляции систем множественной лекарственной устойчивости у дрожжей. Изучение молекулярного механизма транслокации ионов натрия различными бактериальными ионными помпами. Выяснение механизма функционирования и физиологической роли хинолоксидаз дыхательных цепей бактерий (цитохромов bd и bo). Исследование регуляции митохондриальной цитохромоксидазы и определение роли центра связывания Са2+/Na+ в этом процессe.

Основные научные результаты

Показано, что липофильные катионы являются мягкими разобщителями, а также, одновременно, индукторами и конкурентными ингибиторами ABC-переносчиков с широкой субстратной специфичностью. Исследован механизм генерации натриевого потенциала Na+-транслоцирующей NADH:хинон оксидоредуктазой, установлена стадия каталитического цикла этого фермента, сопряженная с трансмембранной транслокацией иона натрия. Определена кинетика генерации электрического потенциала Na+-транслоцирующим родопсином и установлен вклад отдельных стадий каталитического цикла в этот процесс. Идентифицирован фермент, осуществляющий ковалентное присоединение FMN к различным белкам эу- и прокариот. Впервые удалось применить прямой электрометрический метод для изучения механизма работы терминальных оксидаз. Установлено, что каталитический цикл цитохромоксидазы состоит из двух фаз: эу-оксидазной (двухэлектронное восстановление кислорода до связанной перекиси) и пероксидазной (две последовательные одноэлектронные стадии восстановления связанной перекиси до воды), разрешены и охарактеризованы индивидуальные стадии внутрибелкового переноса заряда. Проведено моделирование спектров кругового дихроизма (КД-спектров) цитохромоксидазы с использованием модели сопряженного диполь-дипольного взаимодействия осцилляторов. Показана роль центра связывания Са2+/Na+ в каталитической субъединице I в регуляции митохондриальной цитохромоксидазы. Определены структурно-функциональные особенности хинолоксидаз, которые наделяют бактерии, включая патогенные, повышенной устойчивостью к стрессовым факторам различной природы.

Участие в совместных научно-исследовательских проектах

Российско-индийский проект по изучению ограничений, накладываемых эффективностью клеточной биоэнергетики, на эффективность систем лекарственной резистентности дрожжей. Со стороны Индии выступает группа проф. Ражендры Прасад, университет Амити. Налажено сотрудничество с Иллинойским университетом (Урбана-Шампейн, Ил., США), Хельсинским университетом, римским Университетом Sapienza, Политехническим институтом Парижа, Институтом технологий Кюсю (Япония), Шеффилдским университетом (Англия).

Грантовая поддержка

Работы отдела в настоящее время поддержаны многочисленными грантами РНФ и РФФИ.

Преподавательская деятельность

  • Д.А.Кнорре “Структура и функция митохондрий” (5 лекций в год, ФББ МГУ)
  • Д.А.Кнорре “Биоинженерия” (1 лекция в год, ФББ МГУ)
  • Ф.Ф. Северин “Молекулярная биология клетки” (курс семинаров, 1 семестр ФББ МГУ)
  • Ф.Ф. Северин “Совершенствование природы человека: жизнь без старости?” (1 лекция в год, межфакультетский курс МГУ)
  • В.Б. Борисов “Биохимия” (годовой курс семинаров, ФББ МГУ)
  • А.В. Богачев “Биоэнергетика” (курс семинаров, 1 семестр ФББ МГУ)

Научное руководство студентами и аспирантами МГУ.

Научные премии

  • Государственная Премия Российской Федерации за выдающиеся работы в области науки и техники для молодых ученых (Богачев А.В., Старков А.А, Попов В.Н. (1998); Борисов В.Б., Силецкий С.А. (1999);
  • премия по биохимии имени А.Н. Баха (Константинов А.А.);
  • премия Европейской академии для молодых ученых СНГ (в разные годы: Богачев А.В., Берцова Ю.В., Борисов В.Б., Кнорре Д.А.);
  • премия Биохимического Общества при Российской Академии Наук для молодых ученых России (Богачев А.В., Борисов В.Б.);
  • премия Академии наук высшей школы России (Борисов В.Б.);
  • премия им. И.И. Шувалова МГУ (Богачев А.В., Борисов В.Б.);
  • премия в конкурсе молодых ученых МГУ ( Борисов В.Б.);
  • премия им. А.Д. Каулена за лучшую работу молодых ученых НИИ ФХБ МГУ (Берцова Ю.В., Борисов В.Б., Ацаркина Н.В.) и др.

Подразделения отдела

1) Научная группа А.В. Богачева
Заведующий: доктор биологических наук, зав. отделом Богачев Александр Валерьевич

2) Лаборатория фотохимии биомембран
Ззаведующий: доктор биологических наук, зав. лабораторией Северин Федор Федорович

3) Лаборатория электронного транспорта
Ззаведующий: кандидат биологических наук, зав. лабораторией Зиновкин Роман Алексеевич

4) Группа В.Б. Борисова
Руководитель: доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник Борисов Виталий Борисович

5) Лаборатория гемопротеидов
Заведующий: кандидат физико-математических наук, зав. лабораторией Арутюнян Александр Мигранович).

 

Статьи

  • Oleynikov I.P., Firsov A.M., Azarkina N.V., Vygodina T.V.(2025) Cholesterol Attenuates the Pore-Forming Capacity of CARC-Containing Amphipathic Peptides. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Borisov Vitaliy B., Forte E.(2025) Carbon Monoxide and Prokaryotic Energy Metabolism. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Borisov Vitaliy B., Giardina Giorgio, Pistoia Gianluca, Forte E.(2025) Cytochrome bd-type oxidases and environmental stressors in microbial physiology. Advances in microbial physiology, >>
  • Borisov Vitaliy B., Forte E.(2025) On the role of the terminal oxidase cytochrome bd in hyper-resistance of Listeria monocytogenes to the macrodiolide antibiotic tartrolon B. PLoS Genetics, >>
  • Борисов В.Б., Арутюнян А.М.(2025) Изучение реакции цитохрома bd-I Escherichia coli в полностью восстановленном состоянии с цианидом с использованием спектроскопии поглощения и кругового дихроизма. Биохимия, >>
  • Borisov Vitaliy B., Arutyunyan Alexander M.(2025) Examination of the Reaction of Escherichia coli Cytochrome bd-I in the Fully Reduced State with Cyanide Using Absorption and Circular Dichroism Spectroscopy. Biochemistry (Moscow), >>
  • Anashkin V.A., Bogachev A.V., Serebryakova M.V., Zavyalova E.G., Bertsova Y.V., Baykov A.A.(2025) Rapid kinetics of H+ transport by membrane pyrophosphatase: evidence for a direct-coupling mechanism. Biochemical and Biophysical Research Communications, >>
  • Bertsova Y.V., Serebryakova M.V., Baykov A.A., Bogachev A.V.(2025) Histidine betaine trimethylammonia-lyase, enzyme coupled with terminal urocanate reductase in Shewanella woodyi grown anaerobically. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, >>
  • Bogachev Alexander V., Baykov Alexander A., Anashkin Victor A., Bertsova Yulia V.(2025) Microbial 2-Enoate Reductases Containing Covalently Bound Flavin Mononucleotide. Biochemistry (Moscow), >>
  • Богачев А.В., Байков А.А., Анашкин В.А., Берцова Ю.В.(2025) Микробные 2-еноатредуктазы, содержащие ковалентно связанный флавинмононуклеотид. Биохимия, >>
  • Roshka Yu A., Markelova N.N., Mashkova S.D., Malysheva K.V., Georgieva M.L., Levshin I.B., Polshakov V.I., Arutyunian A.M., Vasilchenko A.S., Sadykova V.S.(2025) Antimicrobial Potential of Secalonic Acids from Arctic-Derived Penicillium chrysogenum INA 01369. Antibiotics, >>
  • Tsvetkov Vladimir, Mir Bartomeu, Alieva Rugiya, Arutyunyan Alexander, Oleynikov Ilya, Novikov Roman, Boravleva Elizaveta, Kamzeeva Polina, Zatsepin Timofei, Aralov Andrey, González Carlos, Zavyalova Elena(2025) Unveiling the unusual i-motif-derived architecture of a DNA aptamer exhibiting high affinity for influenza A virus. Nucleic Acids Research, >>
  • Ксенофонтов А.Л., Петухов М.В., Петерс Г.С., Арутюнян А.М., Л А.Баратова, Архипенко М.В., Никитин Н.А., Карпова О.В., Э В.Штыкова(2025) Влияние in situ ограниченного протеолиза Х-вируса картофеля на изменение структуры вирионов, согласно данным малоуглового рентгеновского рассеяния и тритиевого мечения. Биохимия, >>
  • Ksenofontov Alexander L., Petoukhov Maxim V., Peters Georgy S., Arutyunyan Alexander M., Baratova Lyudmila A., Arkhipenko Marina V., Nikitin Nikolai A., Karpova Olga V., Shtykova Eleonora V.(2025) Influence of in situ Limited Proteolysis of Potato Virus X on Change in the Structure of Virions According to the Small-Angle X-Ray Scattering Data and Tritium Labeling. Biochemistry (Moscow), >>
  • Якушкина Ю.В., Кубарева Е.А., Никифорова Л.А., Арутюнян А.М., Зверева М.Э., Монахова М.В.(2025) Репортерная система для детекции G-квадруплексов в промотроной области гена обратной транскриптазы теломеразы человека. Биохимия, >>
  • Bakeeva L.E., Vays V.B., Vangeli I.M., Eldarov C.M., Popkov V.A., Zorova L.D., Zorov S.D., Zorov* D.B.(2025) Mitochondrial reticulum of skeletal muscles. Proven and hypothetical functions. Biochemistry (Moscow), >>
  • Бакеева Л.Е., Вайс В.Б., Вангели И.М., Эльдаров Ч.М., Попков В.А., Зорова Л.Д., Зоров С.Д., Зоров Д.Б.(2025) Митохондриальная организация в скелетных мышцах мыши и голого землекопа. Доказанные и гипотетические функции. Биохимия, >>
  • Ivaneev Alexandr I., Ermolin Mikhail S., Zinovkin Roman A., Dashkevich Anna A., Zinovkina Ludmila A., Chernyak Boris V., Fedotov Petr S.(2025) Separation and preparation of nanoparticles of urban dust for biological studies. Analytical Methods, >>
  • Pavlyuchenkova Anastasia N., Vorobjeva Nina V., Ivaneev Alexander I., Ermolin Mikhail S., Fedotov Petr S., Zinovkin Roman A., Chelombitko Maria A., Chernyak Boris V.(2025) Urban dust nanoparticles drive inflammatory activation of human neutrophils and macrophages in vitro. Environmental Science and Pollution Research, >>
  • Зиновкин Р.А., Кондратенко Н.Д.(2025) АНТИБИОТИКИ И КЛЕТОЧНОЕ СТАРЕНИЕ: НЕИССЛЕДОВАННАЯ ТЕРРИТОРИЯ. Биохимия, >>
  • Zinovkin Roman A., Kondratenko Nataliya D.(2025) Antibiotics and Cellular Senescence: An Unexplored Territory. Biochemistry (Moscow), >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Smirnova Ekaterina A., Kireeva Natalia A., Ksenofontov Alexandr L., Tashlitsky Vadim N., Severin Fedor F.(2025) Cells Dying via the AP-3 Complex-Dependent Regulated Death Pathway Support the Surviving Cells under Amino Acid Deficiency Conditions. Biochemistry (Moscow), >>
  • Iliushchenko Dmitrii, Efimenko Bogdan, Mikhailova Alina G., Shamanskiy Victor, Saparbaev Murat K., Matkarimov Bakhyt T., Mazunin Ilya, Voronka Alexandr, Knorre Dmitry, Kunz Wolfram S., Kapranov Philipp, Denisov Stepan, Fellay Jacques, Khrapko Konstantin, (2025) Deciphering the Foundations of Mitochondrial Mutational Spectra: Replication-Driven and Damage-Induced Signatures Across Chordate Classes. Molecular Biology and Evolution, >>
  • Kashko Nataliia D., Muravyov Georgii, Karavaeva Iuliia, Glagoleva Elena S., Logacheva Maria D., Garushyants Sofya K., Knorre Dmitry A.(2025) Inheritance bias of deletion-harbouring mtDNA in yeast: The role of copy number and intracellular selection. PLoS Genetics, >>
  • Zubareva Valeria M., Galkina Kseniia V., Lapashina Anna S., Sokolov Svyatoslav S., Markova Olga V., Knorre Dmitry A., Feniouk Boris A.(2025) γM23K Mutation Enhances ADP Inhibition of Mitochondrial F-ATPase Yet Has a Minor Effect on Yeast Growth Rate. Archives of Biochemistry and Biophysics, >>
  • Муравьёв Г., Кнорре Д.А.(2025) ФАКТОРЫ ВНУТРИКЛЕТОЧНОГО ОТБОРА МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК. Биохимия, >>
  • Muravyov Georgii, Knorre Dmitry A.(2025) Mechanisms of Intracellular Selection of Mitochondrial DNA. Biochemistry (Moscow), >>
  • Alieva Rugiya, Sokolova Svetlana, Oleynikov Ilya, Novikov Roman, Zatsepin Timofei, Aralov Andrey, Zavyalova Elena(2025) A Nucleotide‐Derived Fluorophore for Visualizing G‐Quadruplex Assembly and Introduction of Cation‐Regulated Activity into the Thrombin Binding Aptamer. Chembiochem : a European journal of chemical biology, >>
  • Kriukova Daria, Spiridonov Vasily, Alekhina Yulia, Perov Nikolai, Teplonogova Maria, Oleynikov Ilya, Knotko Alexander, Yaroslavov Alexander(2025) Hybrid magnetic hydrogels from natural and synthetic polyanions. Chemical Physics Letters, >>
  • Zorova L.D., Semenovich D.S., Zorov S.D., Oleynikov I.P., Kargapoltceva A.S., Prutskikh D.V., Abramicheva P.A., Pevzner I.B., Sukhikh G.T., Zorov D.B.(2025) Redox Modulation in Therapy of Cancer: Some Pros and Cons. ANTIOXIDANTS, >>
  • Соколов Святослав Сергеевич, Зырина Анна Николаевна, Акимов Сергей Александрович, Северин Федор Федорович(2025) ВЗАИМОСВЯЗЬ НЕВЕЗИКУЛЯРНОГО ТРАНСПОРТА СТЕРИНОВ И ИХ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ МЕЖДУ РАФТАМИ И НЕРАФТОВОЙ ФАЗОЙ ПЛАЗМАТИЧЕСКОЙ МЕМБРАНЫ. Biochemistry (Moscow), >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Zyrina Anna N., Akimov Sergey A., Severin Fedor F.(2025) Interrelationship between the Non-Vesicular Transport of Sterols and Their Distribution between the Rafts and the Non-Raft Phase of the Plasma Membrane. Biochemistry (Moscow), >>
  • Соколов* С.С., Смирнова Е.А., Киреева Н.А., Ксенофонтов А.Л., Ташлицкий В.Н., Северин Ф.Ф.(2025) КЛЕТКИ, УМЕРШИЕ ЗАВИСИМЫМ ОТ КОМПЛЕКСА АР-3 ПУТЕМ РЕГУЛИРУЕМОЙ СМЕРТИ, ПОДДЕРЖИВАЮТ ВЫЖИВШИХ В УСЛОВИЯХ ДЕФИЦИТА АМИНОКИСЛОТ. Biochemistry (Moscow), >>
  • Chertkova Rita V., Oleynikov Ilya P., Pakhomov Alexey A., Sudakov Roman V., Semenova Marina A., Arutyunyan Alexander M., Ptushenko Vasily V., Kirpichnikov Mikhail P., Dolgikh Dmitry A., Vygodina Tatiana V.(2024) The Increase in the Peroxidase Activity of the Cytochrome C with Substitutions in the Universal Binding Site is Associated with Changes in the Ability to Interact with External Ligands. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Borisov Vitaliy B., Arutyunyan Alexander M.(2024) The fully reduced terminal oxidase bd-I isolated from Escherichia coli binds cyanide. Journal of Inorganic Biochemistry, >>
  • Grivennikova Vera G., Gladyshev Grigory V., Zharova Tatyana V., Borisov Vitaliy B.(2024) Proton-Translocating NADH–Ubiquinone Oxidoreductase: Interaction with Artificial Electron Acceptors, Inhibitors, and Potential Medicines. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Nastasi M.R., Borisov V.B., Forte E.(2024) Membrane-Bound Redox Enzyme Cytochrome bd-I Promotes Carbon Monoxide-Resistant Escherichia coli Growth and Respiration. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Bogachev A.V., Anashkin V.A., Bertsova Y.V., Zavyalova E.G., Baykov A.A.(2024) Na+ Translocation Dominates over H+-Translocation in the Membrane Pyrophosphatase with Dual Transport Specificity. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Bertsova Y.V., Serebryakova M.V., Anashkin V.A., Baykov A.A., Bogachev A.V.(2024) A redox-regulated, heterodimeric NADH:cinnamate reductase in Vibrio ruber. Biochemistry (Moscow), >>
  • Bertsova Y.V., Serebryakova M.V., Bogachev V.A., Baykov A.A., Bogachev A.V.(2024) Acrylate reductase of an anaerobic electron transport chain of the marine bacterium Shewanella woodyi. Biochemistry (Moscow), >>
  • Берцова Ю.В., Серебрякова М.В., Богачев В.А., Байков А.А., Богачев А.В.(2024) Акрилатредуктаза анаэробной электрон-транспортной цепи морской бактерии Shewanella woodyi. Биохимия, >>
  • Петровская Л.Е., Крюкова Е.А., Большаков В.А., Лукашев Е.П., Силецкий С.А., Мамедов М.Д., Судаков Р.В., Долгих Д.А., Кирпичников М.П.(2024) ГИБРИДНЫЕ БЕЛКИ, СОДЕРЖАЩИЕ ПРОТЕОРОДОПСИН Exiguobacterium sibiricum. Биоорганическая химия, >>
  • Petrovskaya L.E., Kryukova E.A., Bolshakov V.A., Lukashev E.P., Siletsky S.A., Mamedov M.D., Sudakov R.V., Dolgikh D.A., Kirpichnikov M.P.(2024) Fusion Proteins Containing Proteorhodopsin from Exiguobacterium sibiricum. Russian Journal of Bioorganic Chemistry, >>
  • Skrabkova Hanna S., Chernysheva Maria G., Baygildiev Timur M., Shnitko Alexey V., Kasperovich Alexandra V., Egorova Tolganay B., Badun Gennadii A., Arutyunyan Alexander M., Ksenofontov Alexander L., Rodin Igor A.(2024) Lysozyme binding with amikacin and levofloxacin studied by tritium probe, fluorescence spectroscopy and molecular docking. Archives of Biochemistry and Biophysics, >>
  • Azarkina N.V.(2024) Requirement of Bacillus subtilis succinate:menaquinone oxidoreductase activity for membrane energization depends on the direction of catalysis. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, >>
  • Vays V.B., Vangeli I.M., Eldarov Ch M., Bakeeva L.E.(2024) Ultrastructure of Mitochondria in Skeletal Muscle Weakened by Sarcopenia during Aging. Biochemistry, Supplemental Series B, >>
  • Назаров П.А., Зиновкина Л.А., Брезгунова А.А., Лямзаев К.Г., Головин А.В., Каракозова М.В., Котова Е.А., Плотников Е.Ю., Зиновкин Р.А., Скулачев М.В., Антоненко Ю.Н.(2024) Соотношение цитотоксического и антимикробного действия коньюгатов трифенилфосфония с различными производными хинона. Биохимия, >>
  • Nazarov Pavel A., Zinovkina Lyudmila A., Brezgunova Anna A., Lyamzaev Konstantin G., Golovin Andrei V., Karakozova Marina V., Kotova Elena A., Plotnikov Egor Yu, Zinovkin Roman A., Skulachev Maxim V., Yuri N.Antonenko(2024) Relationship of Cytotoxic and Antimicrobial Effects of Triphenylphosphonium Conjugates with Various Quinone Derivatives. Biochemistry (Moscow), >>
  • Павлюченкова А.Н., Воробьева Н.В., Дашкевич А.А., Зиновкина Л.А., Иванеев А.И., Ермолин М.С., Федотов П.С., Зиновкин Р.А., Челомбитько М.А., Черняк Б.В.(2024) Наночастицы городской пыли вызывают провоспалительную активацию нейтрофилов и макрофагов. Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, >>
  • Pavlyuchenkova A.N., Vorobjeva N.V., Dashkevich A.A., Zinovkina L.A., Ivaneev A.I., Ermolin M.S., Fedotov P.S., Zinovkin R.A., Chelombitko M.A., Chernyak B.V.(2024) Urban Dust Nanoparticles Induce Pro-inflammatory Activation of Neutrophils and Macrophages. Moscow University biological sciences bulletin, >>
  • Zinovkin Roman A., Sakharov Ivan Yu(2024) Challenges of using microRNAs as potential disease biomarkers. A review. Microchemical Journal, >>
  • Epremyan Khoren K., Burlaka Arteom A., Markova Olga V., Galkina Kseniia V., Knorre Dmitry A.(2024) Mitochondrial Genome Instability in W303-SK1 Yeast Cytoplasmic Hybrids. Biology, >>
  • Potapenko Elena Yu, Kashko Nataliia D., Knorre Dmitry A.(2024) Flow-cytometry reveals mitochondrial DNA accumulation in Saccharomyces cerevisiae cells during cell cycle arrest. Frontiers in Cell and Developmental Biology, >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Smirnova Ekaterina A., Rokitskaya Tatyana I., Severin Fedor F.(2024) The Imidazolium Ionic Liquids Toxicity is Due to Their Effect on the Plasma Membrane. Biochemistry (Moscow), >>
  • Sokolov S.S., Akimov S.A., Severin F.F.(2024) Evolutionary Choice between Cholesterol and Ergosterol. Biochemistry, Supplemental Series A, >>
  • Соколов С.С., Акимов С.А., Северин Ф.Ф.(2024) ЭВОЛЮЦИОННЫЙ ВЫБОР МЕЖДУ ХОЛЕСТЕРИНОМ И ЭРГОСТЕРИНОМ. Биологические мембраны, >>
  • Uzbekov Rustem, Uzbekova Svetlana, Severin Fedor, Prigent Claude, Arlot-Bonnemains Yannick(2024) Aurora A Kinase Begins to Localize to the Centrosome in the S-phase of the Cell Cycle in the XL2 Cell Line. Frontiers in Bioscience-Landmark, >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Severin Fedor F.(2024) Two Types of Survival Curves of Different Lines of Progeric Mice. Biochemistry (Moscow), >>
  • Chertkova Rita V., Oleynikov Ilya P., Pakhomov Alexey A., Sudakov Roman V., Orlov Victor N., Semenova Marina A., Arutyunyan Alexander M., Ptushenko Vasily V., Kirpichnikov Mikhail P., Dolgikh Dmitry A., Vygodina Tatiana V.(2023) Mutant Cytochrome C as a Potential Detector of Superoxide Generation: Effect of Mutations on the Function and Properties. Cells, >>
  • Oleynikov Ilya P., Sudakov Roman V., Radyukhin Victor A., Arutyunyan Alexander M., Azarkina Natalia V., Vygodina Tatiana V.(2023) Interaction of Amphipathic Peptide from Influenza Virus M1 Protein with Mitochondrial Cytochrome Oxidase. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Azarkina N.V., Borisov V.B., Oleynikov I.P., Sudakov R.V., Vygodina T.V.(2023) Interaction of Terminal Oxidases with Amphipathic Molecules. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Выгодина Т.В., Зоров Д.Б.(2023) Памяти Владимира Петровича Скулачева. Биологические мембраны, >>
  • Азбарова А.В., Кнорре Д.А.(2023) Роль митохондриальной ДНК в репликативном старении дрожжей. Биохимия, >>
  • Azbarova Aglaia V., Knorre Dmitry A.(2023) Role of Mitochondrial DNA in Yeast Replicative Aging. Biochemistry (Moscow), >>
  • Борисов В.Б., Nastasi M.R., Forte E.(2023) Цитохром bd как антиоксидантный редокс-фермент. Молекулярная биология, >>
  • Борисов В.Б.(2023) Генерация мембранного потенциала цитохромом bd. Биохимия, >>
  • Borisov V.B.(2023) Generation of Membrane Potential by Cytochrome bd. Biochemistry (Moscow), >>
  • Borisov V.B., Nastasi M.R., Forte E.(2023) Cytochrome bd as Antioxidant Redox Enzyme. Molecular Biology, >>
  • Skulachev V.P., Vyssokikh M.Y., Chernyak B.V., Mulkidjanian A.Y., Skulachev M.V., Shilovsky G.A., Lyamzaev K.G., Borisov V.B., Severin F.F., Sadovnichii V.A.(2023) Six Functions of Respiration: Isn’t It Time to Take Control over ROS Production in Mitochondria, and Aging Along with It?. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Nastasi M.R., Borisov V.B., Forte E.(2023) The terminal oxidase cytochrome bd-I confers carbon monoxide resistance to Escherichia coli cells. Journal of Inorganic Biochemistry, >>
  • Zharova Tatyana V., Grivennikova Vera G., Borisov Vitaliy B.(2023) F1·Fo ATP Synthase/ATPase: Contemporary View on Unidirectional Catalysis. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Zorova Ljubava D., Pevzner Irina B., Khailova Ljudmila S., Korshunova Galina A., Kovaleva Marina A., Kovalev Leonid I., Serebryakova Marina V., Silachev Denis N., Sudakov Roman V., Zorov Savva D., Rokitskaya Tatyana I., Popkov Vasily A., Plotnikov Egor Y.(2023) Mitochondrial ATP Synthase and Mild Uncoupling by Butyl Ester of Rhodamine 19, C4R1. ANTIOXIDANTS, >>
  • Акуневич А.А., Хрусталёв В.В., Хрусталёва Т.А., Кордюкова Л В., Арутюнян А.М.(2023) Роль дисульфидных связей в формировании пространственной структуры эпидермального фактора роста человека. Vestsi Natsyi∎anal∎na∎ akad∎mii navuk Belarusi. Seryi∎a bii∎alahichnykh navuk, >>
  • Savitskaya V.Y., Strekalovskikh V.V., Snyga V.G., Monakhova M.V., Arutyunyan A.M., Dolinnaya N.G., Kubareva E.A.(2023) pilE G-QuadruplexIs recognized and preferentially bound but not processed by the MutL endonuclease from Neisseria gonorrhoeae mismatch repair pathway. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Ksenofontov Alexander L., Petoukhov Maxim V., Matveev Vladimir V., Fedorova N.V., Semenyuk Pavel I., Arutyunyan Alexander M., Manukhova Tatiana I., Evtushenko Ekaterina A., Nikitin Nikolai A., Karpova Olga V., Shtykova Eleonora V.(2023) Effect of the Coat Protein N-Terminal Domain Structure on the Structure and Physicochemical Properties of Virions of Potato Virus X and Alternanthera Mosaic Virus. Biochemistry (Moscow), >>
  • Ксенофонтов А.Л., Петухов М.В., Матвеев В.В., Федорова Н.В., Семенюк П.И., Арутюнян А.М., Манухова Т.И., Евтушенко Е.А., Никитин Н.А., Карпова О.В., Штыкова Э.В.(2023) Влияние структуры N-концевого домена белка оболочки X-вируса картофеля и вируса мозаики альтернантеры на структуру и физико-химические свойства вирионов. Биохимия, >>
  • Егоров Е.С., Кондратенко Н.Д., Аверина О.А., Пермяков О.А., Емельянова М.А., Приходько А.С., Зиновкина Л.А., Сергиев Петр Владимирович, Зиновкин Р.А.(2023) Характеристика новой линии мышей с мутацией в гене NFE2L2 (NRF2). Биохимия, >>
  • Egorov Evgeniy S., Kondratenko Natalia D., Averina Olga A., Permyakov Oleg A., Emelyanova Maria A., Prikhodko Anastasia S., Zinovkina Ludmila A., Sergiev Petr V., Zinovkin Roman A.(2023) A New Mouse Strain with a Mutation in the NFE2L2 (NRF2) Gene. Biochemistry (Moscow), >>
  • Skulachev VP, Vyssokikh MY, Chernyak BV, Averina OA, Andreev-Andrievskiy AA, Zinovkin RA, Lyamzaev KG, Marey MV, Egorov MV, Frolova OJ, Zorov DB, Skulachev MV, Sadovnichii VA(2023) Mitochondrion-targeted antioxidant SkQ1 prevents rapid animal death caused by highly diverse shocks. Scientific reports, >>
  • Zinovkin Roman A., Zinovkina Liudmila A., Makievskaya Ciara I., Galkin Ivan I.(2023) Mitochondria-Targeted Uncouplers Decrease Inflammatory Reactions in Endothelial Cells by Enhancing Methylation of the ICAM1 Gene Promoter. Current molecular pharmacology, >>
  • Epremyan Khoren K., Rogov Anton G., Goleva Tatyana N., Lavrushkina Svetlana V., Zinovkin Roman A., Zvyagilskaya Renata A.(2023) Altered Mitochondrial Morphology and Bioenergetics in a New Yeast Model Expressing Abeta42. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Кондратенко Н.Д., Зиновкина Л.А., Зиновкин Р.А.(2023) ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ ФАКТОР NRF2 В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЭНДОТЕЛИЯ. Молекулярная биология, >>
  • Chelombitko M.A., Morgunova G.V., Strochkova N.Yu, Zinovkin R.A., Pavlyuchenkova A.N., Kondratenko N.D., Lyamzaev K.G.(2023) Comparative analysis of cell senescence induced by the chemotherapeutic agents doxorubicin, cisplatin and arsenic trioxide in human myoblasts. Advances in Gerontology, >>
  • Zinovkin Roman A.(2023) Phenoptosis. Preface to the Special Issue. Biochemistry (Moscow), >>
  • Vorobjeva NV, Chelombitko MA, Sud’ina GF, Zinovkin RA, Chernyak BV(2023) Role of mitochondria in the regulation of effector functions of granulocytes. Cells, >>
  • Zinovkin Roman A., Lyamzaev Konstantin G., Chernyak Boris V.(2023) Current perspectives of mitochondria-targeted antioxidants in cancer prevention and treatment. Frontiers in Cell and Developmental Biology, >>
  • Зиновкин Р.А.(2023) От редакции. Биохимия, >>
  • Pavlyuchenkova Anastasia N., Chelombitko Maria A., Fedorov Artem V., Kuznetsova Maria K., Zinovkin Roman A., Razin Ehud(2023) The Distinct Effects of the Mitochondria-Targeted STAT3 Inhibitors Mitocur-1 and Mitocur-3 on Mast Cell and Mitochondrial Functions. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Noskova Elizaveta O., Markova Olga V., Knorre Dmitry A., Galkina Kseniia V.(2023) Tyrosol induces multiple drug resistance in yeast Saccharomyces cerevisiae. Frontiers in microbiology, >>
  • Burlaka A.A., Glagoleva E.S., Kashko N.D., Knorre D.A.(2023) Genetic Screening using High-Throughput Barcode Sequencing of Saccharomyces cerevisiae Knockout Collection: Search for Regulators of mtDNA Intracellular Selection. Microbiology, >>
  • Potapenko Elena Yu, Kashko Nataliia D., Knorre Dmitry A.(2023) Spontaneous Mutations in Saccharomyces cerevisiae mtDNA Increase Cell-to-Cell Variation in mtDNA Amount. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Selifanova Maria, Demianchenko Oleg, Noskova Elizaveta, Pitikov Egor, Skvortsov Denis, Drozd Jana, Vatolkina Nika, Apel Polina, Kolodyazhnaya Ekaterina, Ezhova Margarita A., Tzetlin Alexander B., Neretina Tatiana V., Knorre Dmitry A.(2023) ORFans in Mitochondrial Genomes of Marine Polychaete Polydora. Genome biology and evolution, >>
  • Sokolov Svyatoslav, Zyrina Anna, Akimov Sergey, Knorre Dmitry, Severin Fedor(2023) Toxic Effects of Penetrating Cations. Membranes, >>
  • Knorre Dmitry A.(2023) Mitochondrial heteroplasmy as a cause of cell-to-cell phenotypic heterogeneity in clonal populations. Frontiers in Cell and Developmental Biology, >>
  • Shamanskiy Victor, Mikhailova Alina A., Tretiakov Evgenii O., Ushakova Kristina, Mikhailova Alina G., Oreshkov Sergei, Knorre Dmitry A., Ree Natalia, Overdevest Jonathan B., Lukowski Samuel W., Gostimskaya Irina, Yurov Valerian, Liou Chia-Wei, Lin Tsu-Kun(2023) Secondary structure of the human mitochondrial genome affects formation of deletions. BMC Biology, >>
  • Fedorov Dmitry, Knorre Dmitry, Kolbasova Glafira, Neretina Tatiana(2023) Mitochondrial genome of Pseudopotamilla reniformis (Annelida: Sabellidae). MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, >>
  • Subekin Alexei, Alieva Rugiya, Kukushkin Vladimir, Oleynikov Ilya, Zavyalova Elena(2023) Rapid SERS Detection of Botulinum Neurotoxin Type A. NANOMATERIALS, >>
  • Diuba* Artem V., Vygodina Tatiana V., Azarkina Natalia V., Arutyunyan Alexander M., Soulimane Tewfik, Vos Marten H., Konstantinov Alexander A.(2022) Individual heme a and heme a3 contributions to the Soret absorption spectrum of the reduced bovine cytochrome c oxidase. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, >>
  • Oleynikov Ilya P., Sudakov Roman V., Azarkina Natalia V., Vygodina Tatiana V.(2022) Direct Interaction of Mitochondrial Cytochrome c Oxidase with Thyroid Hormones: Evidence for Two Binding Sites. Cells, MDPI (Basel, Switzerland) 2022. Cells, >>
  • Форте Е., Настаси М.Р., Борисов В.Б.(2022) Препараты терминальной оксидазы цитохрома bd-II, выделенные из Escherichia coli, обнаруживают значительную активность в удалении перекиси водорода. Биохимия, >>
  • Forte E., Nastasi M.R., Borisov V.B.(2022) Preparations of Terminal Oxidase Cytochrome bd-II Isolated from Escherichia coli Reveal Significant Hydrogen Peroxide Scavenging Activity. Biochemistry (Moscow), >>
  • Borisov V.B., Forte E.(2022) Bioenergetics and Reactive Nitrogen Species in Bacteria. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Friedrich T., Wohlwend D., Borisov V.B.(2022) Recent Advances in Structural Studies of Cytochrome bd and Its Potential Application as a Drug Target. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Bogachev A.V., Baykov A.A., Bertsova Y.V., Mamedov M.D.(2022) Mechanism of ion translocation by Na+-rhodopsin. Biochemistry (Moscow), >>
  • Bertsova Y.V., Serebryakova M.V., Baykov A.A., Bogachev A.V.(2022) A novel, NADH-dependent acrylate reductase in Vibrio harveyi. Applied and Environmental Microbiology, >>
  • Rokitskaya T.I., Arutyunyan A.M., Khailova Ljudmila S., Kataeva Alisa D., Firsov Alexander M., Kotova Elena A., Antonenko Yuri N.(2022) Usnic Acid-Mediated Exchange of Protons for Divalent Metal Cations across Lipid Membranes: Relevance to Mitochondrial Uncoupling. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Zavyalova Elena, Tikhonova Daria, Zhdanov Gleb, Rudakova Elena, Alferova Vera, Moiseenko Andrey, Kamzeeva Polina, Khrulev Alexei, Zalevsky Arthur, Arutyunyan Alexander, Novikov Roman, Kukushkin Vladimir, Aralov Andrey(2022) SERS-based biosensor with Raman-active external responsive element for rapid determination of adenosine monophosphate. Analytica Chimica Acta, >>
  • Akunevich A.A., Khrustalev V.V., Khrustaleva T.A., Poboinev V.V., Shalygo N.V., Stojarov A.N., Arutyunyan A.M., Kordyukova L.V., Sapon Y.G.(2022) Equilibrium Between Dimeric and Monomeric Forms of Human Epidermal Growth Factor is Shifted Towards Dimers in a Solution. Protein Journal, >>
  • Khrustalev V.V., Kordyukova L.V., Arutyunyan A.M., Poboinev V.V., Khrustaleva T.A., Stojarov A.N., Baratova L.A., Sapon A.S., Lugin V.G.(2022) The cytoplasmic tail of Influenza A/H1N1 virus hemagglutinin is β-structural. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, >>
  • Vays Valeriya, Vangeli Irina, Eldarov Chupalav, Popkov Vasily, Holtze Susanne, Hildebrandt Thomas, Averina Olga, Zorov Dmitry, Bakeeva Lora(2022) Unique Features of the Tissue Structure in the Naked Mole Rat (Heterocephalus glaber): Hypertrophy of the Endoplasmic Reticulum and Spatial Mitochondrial Rearrangements in Hepatocytes. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Шульга Ю.М., Кабачков Е.Н., Корепанов В.И., Кичигина Г.А., Кущ П.П., Кирюхин Д.П., Дремова Н.Н., Баскаков С.А., Vaish Rahul, Kumar Yogesh(2022) ГИДРОФОБИЗАЦИЯ МЕЛАМИНОВЫХ ГУБОК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ РАДИЦИОННО-СИНТЕЗИРОВАННЫХ ТЕЛОМЕРОВ ТЕТРАФТОРЭТИЛЕНА. Химия высоких энергий, >>
  • Zorova Ljubava D., Kovalchuk Sergei I., Popkov Vasily A., Chernikov Valery P., Zharikova Anastasia A., Khutornenko Anastasia A., Zorov Savva D., Plokhikh Konstantin S., Zinovkin Roman A., Evtushenko Ekaterina A., Babenko Valentina A., Pevzner Irina B., Sh(2022) Do Extracellular Vesicles Derived from Mesenchymal Stem Cells Contain Functional Mitochondria?. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Chelombitko M.A., Galkin I.I., Pletjushkina O.Yu, Zinovkin R.A., Popova E.N.(2022) Effect of Antioxidants on the Production of MCP-1 Chemokine by EA.hy926 Cells in Response to IL-6. Moscow University biological sciences bulletin, >>
  • Fedorov Artem V., Chelombitko Maria A., Chernyavskij Daniil A., Galkin Ivan I., Pletjushkina Olga Yu, Vasilieva Tamara V., Zinovkin Roman A., Chernyak Boris V.(2022) Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 Prevents the Development of Experimental Colitis in Mice and Impairment of the Barrier Function of the Intestinal Epithelium. Cells, >>
  • Челомбитько М.А., Галкин И.И., Плетюшкина О.Ю., Зиновкин Р.А., Попова Е.Н.(2022) Влияние антиоксидантов на продукцию хемокина MCP-1 клетками линии EA.hy926 в ответ на IL-6. Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, >>
  • Pavlyuchenkova Anastasia N., Zinovkin Roman A., Makievskaya Ciara I., Galkin Ivan I., Chelombitko Maria A.(2022) Mitochondria-targeted triphenylphosphonium-based compounds inhibit FceRI-dependent degranulation of mast cells by preventing mitochondrial dysfunction through Erk1/2. Life Sciences, >>
  • Epremyan Khoren K., Goleva Tatyana N., Rogov Anton G., Lavrushkina Svetlana V., Zinovkin Roman A., Zvyagilskaya Renata A.(2022) The First Yarrowia lipolytica Yeast Models Expressing Hepatitis B Virus X Protein: Changes in Mitochondrial Morphology and Functions. Microorganisms, >>
  • Зиновкин Р.А., Кондратенко Н.Д., Зиновкина Л.А.(2022) ЯВЛЯЕТСЯ ЛИ NRF2 ОСНОВНЫМ РЕГУЛЯТОРОМ СТАРЕНИЯ МЛЕКОПИТАЮЩИХ?. Биохимия, >>
  • Zinovkin Roman A., Kondratenko Natalia D., Zinovkina Ludmila A.(2022) Does Nrf2 Play a Role of a Master Regulator of Mammalian Aging?. Biochemistry (Moscow), >>
  • Sokolov Alexey V., Chernyak Boris V., Zinovkin Roman A., Hwang Tsong-Long, Sud’ina Galina F.(2022) Editorial: Pharmacological Approaches Targeting Neutrophilic Inflammation: Volume II. Frontiers in pharmacology, >>
  • Lyamzaev Konstantin G., Zinovkin Roman A., Chernyak Boris V.(2022) Extrusion of mitochondria: garbage clearance or cell‐cell communication signals?. Journal of Cellular Physiology, >>
  • Kireeva Nataliia, Galkina Kseniia, Sokolov Sviatoslav, Knorre Dmitry(2022) Role of Dead Cells in Collective Stress Tolerance in Microbial Communities: Evidence from Yeast. Biochemistry (Moscow), >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Popova Marina M., Pohl Peter, Horner Andreas, Akimov Sergey A., Kireeva Natalia A., Knorre Dmitry A., Batishchev Oleg V., Severin Fedor F.(2022) Structural Role of Plasma Membrane Sterols in Osmotic Stress Tolerance of Yeast Saccharomyces cerevisiae. Membranes, >>
  • Lapashina Anna S., Kashko Nataliia D., Zubareva Valeria M., Galkina Kseniia V., Markova Olga V., Knorre Dmitry A., Feniouk Boris A.(2022) Attenuated ADP-inhibition of FOF1 ATPase mitigates manifestations of mitochondrial dysfunction in yeast. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, >>
  • Galkina Kseniia V., Zubareva Valeria M., Kashko Nataliia D., Lapashina Anna S., Markova Olga V., Feniouk Boris A., Knorre Dmitry A.(2022) Heterogeneity of starved yeast cells in IF1 levels suggests the role of this protein in vivo. Frontiers in microbiology, >>
  • Sokolov Svyatoslav S., Volynsky Pavel E., Zangieva Olga T., Severin Fedor F., Glagoleva Elena S., Knorre Dmitry A.(2022) Cytostatic effects of structurally different ginsenosides on yeast cells with altered sterol biosynthesis and transport. Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes, >>
  • Mikhailova Alina G., Mikhailova Alina A., Ushakova Kristina, Tretiakov Evgeny O., Iliushchenko Dmitrii, Shamansky Victor, Lobanova Valeria, Kozenkov Ivan, Efimenko Bogdan, Yurchenko Andrey A., Kozenkova Elena, Zdobnov Evgeny M., Makeev Vsevolod, Yurov Val(2022) A mitochondria-specific mutational signature of aging: increased rate of A > G substitutions on the heavy strand. Nucleic Acids Research, >>
  • Marie Hardwick J., Knorre Dmitry, Palkova Zdena, Winderickx Joris(2022) Editorial: Yeast Differentiation: From Cell-to-Cell Heterogeneity to Replicative Aging and Regulated Cell Death. Frontiers in Cell and Developmental Biology, >>
  • Vorobjeva N.V., Galkin I.I., Pletjushkina O.Y., Golyshev S.A., Zinovkin R.A., Prikhodko A.S., Pinegin V.B., Kondratenko I.V., Pinegin B.V., Chernyak B.V.(2020) Mitochondrial permeability transition pore is involved in oxidative burst and NETosis of human neutrophils. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease, >>
  • Vorobjeva N., Prikhodko A., Galkin I., Pletjushkina O., Zinovkin R., Sud’ina G., Chernyak B., Pinegin B.(2017) Mitochondrial reactive oxygen species are involved in chemoattractant-induced oxidative burst and degranulation of human neutrophils in vitro. European Journal of Cell Biology, >>
  • Zakharova Vlada V., Pletjushkina Olga Yu, Galkin Ivan I., Zinovkin Roman A., Chernyak Boris V., Krysko Dmitri V., Bachert Claus, Krysko Olga, Skulachev Vladimir P., Popova Ekaterina N.(2017) Low concentration of uncouplers of oxidative phosphorylation decreases the TNF-induced endothelial permeability and lethality in mice. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease, >>
  • Demyanenko I.A., Zakharova V.V., Ilyinskaya O.P., Vasilieva T.V., Fedorov A.V., Manskikh V.N., Zinovkin R.A., Pletjushkina O.Y., Chernyak B.V., Skulachev V.P., Popova E.N.(2017) Mitochondria-targeted antioxidant SkQ1 improves dermal wound healing in genetically diabetic mice. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, >>
  • Zakharova VV, Pletjushkina OY, Zinovkin RA, Popova EN, Chernyak BV(2016) Mitochondria-Targeted Antioxidants and Uncouplers of Oxidative Phosphorylation in Treatment of the Systemic Inflammatory Response Syndrome (SIRS). Journal of Cellular Physiology, >>